181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0210 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  97.17 
 
 		 318 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  100 
 
 		 318 aa  664    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  78.48 
 
 		 317 aa  520  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  55.24 
 
 		 312 aa  351  1e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  42.53 
 
 		 305 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  40.45 
 
 		 318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  35.94 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  32.92 
 
 		 437 aa  97.4  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  34.89 
 
 		 409 aa  95.9  9e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  33.06 
 
 		 620 aa  94  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  30.77 
 
 		 400 aa  93.6  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  32.72 
 
 		 613 aa  90.9  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  30 
 
 		 404 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  37.95 
 
 		 430 aa  88.6  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  32.64 
 
 		 418 aa  87  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  35.09 
 
 		 617 aa  86.7  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  34.41 
 
 		 422 aa  86.3  6e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  29.04 
 
 		 448 aa  84  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  30.35 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  32.22 
 
 		 420 aa  82.4  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  33.19 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  32.22 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  32.22 
 
 		 420 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  32.22 
 
 		 420 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  31.22 
 
 		 435 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  32.22 
 
 		 420 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  25.98 
 
 		 418 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  30.85 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  31.42 
 
 		 413 aa  79.7  0.00000000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  29.47 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  29.77 
 
 		 408 aa  79  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  27.75 
 
 		 454 aa  77.8  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  31.53 
 
 		 425 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  32.74 
 
 		 396 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  32.23 
 
 		 413 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  29.91 
 
 		 418 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.51 
 
 		 425 aa  72.8  0.000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  31.44 
 
 		 381 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  32.85 
 
 		 443 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  39.34 
 
 		 251 aa  72  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  35.33 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  26.32 
 
 		 435 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  27.84 
 
 		 526 aa  67.8  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  26.01 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  28.46 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  27.98 
 
 		 432 aa  67  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 		 422 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  28.26 
 
 		 414 aa  67  0.0000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  25.75 
 
 		 423 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  33.06 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  28.31 
 
 		 411 aa  64.3  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  28.11 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  29.26 
 
 		 415 aa  64.7  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30.85 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  26.83 
 
 		 409 aa  64.3  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  28.57 
 
 		 410 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  27.43 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  25.45 
 
 		 433 aa  63.2  0.000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  30.21 
 
 		 416 aa  63.2  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  31.85 
 
 		 453 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  26.63 
 
 		 415 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  29.84 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  28.9 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  31.29 
 
 		 427 aa  60.8  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  25.24 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  31.15 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  32.04 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  31.87 
 
 		 527 aa  60.1  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  27.56 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  26.24 
 
 		 447 aa  60.1  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  29.56 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  27.56 
 
 		 415 aa  59.3  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  27.17 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  27.81 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  35.45 
 
 		 434 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  33.33 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  31.36 
 
 		 435 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  31.38 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  31.38 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  31.38 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  32.26 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  35.45 
 
 		 434 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  31.38 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  31.38 
 
 		 440 aa  57.4  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  33.85 
 
 		 450 aa  57  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.73 
 
 		 439 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  34.55 
 
 		 434 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  28.34 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  34.55 
 
 		 434 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  30.32 
 
 		 351 aa  55.5  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  26.17 
 
 		 390 aa  54.7  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  28 
 
 		 432 aa  54.7  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  26.84 
 
 		 435 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  26.79 
 
 		 419 aa  55.1  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  28.97 
 
 		 457 aa  54.7  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  30.28 
 
 		 446 aa  54.3  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 435 aa  54.3  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  27.15 
 
 		 451 aa  53.9  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  28.74 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>