135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_0226 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  100 
 
 
415 aa  840    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  81.93 
 
 
415 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  82.37 
 
 
414 aa  715    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  68.19 
 
 
415 aa  581  1e-164  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  65.78 
 
 
415 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  60.96 
 
 
415 aa  487  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  42.48 
 
 
418 aa  301  1e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  42.75 
 
 
414 aa  263  3e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  40.59 
 
 
421 aa  257  2e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  38.42 
 
 
434 aa  248  1e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  39.72 
 
 
423 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  37.98 
 
 
414 aa  242  9e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  38.65 
 
 
441 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  37.73 
 
 
433 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  39.24 
 
 
435 aa  224  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  38.08 
 
 
425 aa  224  3e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  39.41 
 
 
414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  34.2 
 
 
410 aa  207  2e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  34.75 
 
 
410 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  31.16 
 
 
390 aa  195  1e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  38.54 
 
 
405 aa  189  7e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  34.19 
 
 
414 aa  176  5e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  33.49 
 
 
420 aa  176  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  34.25 
 
 
460 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  31.8 
 
 
435 aa  170  4e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  34.53 
 
 
412 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  31.5 
 
 
412 aa  163  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  32.98 
 
 
407 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  32.94 
 
 
435 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  32.23 
 
 
411 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  30.57 
 
 
430 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  33.43 
 
 
419 aa  138  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  32.87 
 
 
387 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  30.2 
 
 
440 aa  136  7.000000000000001e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  32.74 
 
 
440 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  31.04 
 
 
430 aa  133  5e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  30.79 
 
 
430 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 
431 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  28.68 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  33.51 
 
 
409 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  32.79 
 
 
420 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  30.21 
 
 
387 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  29.62 
 
 
330 aa  127  4.0000000000000003e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  33.64 
 
 
420 aa  117  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  30.05 
 
 
429 aa  107  3e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  30.28 
 
 
417 aa  104  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  26.92 
 
 
408 aa  99  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  28.23 
 
 
405 aa  96.7  7e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.43 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  28.37 
 
 
407 aa  95.9  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  29.1 
 
 
418 aa  93.6  6e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  26.16 
 
 
426 aa  92.8  9e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  30.36 
 
 
431 aa  92.4  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  30.18 
 
 
431 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  32 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  32 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  32 
 
 
419 aa  90.1  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4226  hypothetical protein  76.47 
 
 
141 aa  88.2  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  31.64 
 
 
419 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  27.02 
 
 
432 aa  87  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  28.82 
 
 
418 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  26.39 
 
 
430 aa  86.3  9e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  25.36 
 
 
429 aa  86.3  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  27.06 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  25.18 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  29.91 
 
 
391 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  27.09 
 
 
429 aa  79  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  34.53 
 
 
152 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  24.11 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  28.07 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  28.78 
 
 
419 aa  76.6  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  29.38 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  25.73 
 
 
449 aa  73.6  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  25.13 
 
 
424 aa  72.8  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  23.4 
 
 
435 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.14 
 
 
434 aa  70.1  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.33 
 
 
439 aa  70.1  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  25.97 
 
 
433 aa  68.6  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  27.17 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  31.33 
 
 
443 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  22.96 
 
 
435 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  27.17 
 
 
318 aa  64.3  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  31.21 
 
 
295 aa  62.4  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  23.85 
 
 
395 aa  60.5  0.00000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  23.98 
 
 
318 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.89 
 
 
430 aa  57.4  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  24.81 
 
 
433 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  28.29 
 
 
312 aa  57  0.0000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  26.94 
 
 
448 aa  56.6  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  27.97 
 
 
317 aa  56.6  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3613  HipA domain protein  27.03 
 
 
443 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  27.66 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  27.33 
 
 
433 aa  54.7  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  27.6 
 
 
462 aa  54.7  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  33.13 
 
 
418 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  25 
 
 
432 aa  53.5  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4986  hypothetical protein  27.15 
 
 
319 aa  53.1  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.85 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 
434 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  28.09 
 
 
414 aa  51.6  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>