155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5344 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  100 
 
 
415 aa  830    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  88.19 
 
 
415 aa  743    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  68.84 
 
 
414 aa  591  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  68.67 
 
 
415 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  65.78 
 
 
415 aa  545  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  63.2 
 
 
415 aa  505  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  43.42 
 
 
418 aa  303  3.0000000000000004e-81  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  41.85 
 
 
421 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  40.34 
 
 
414 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  37.59 
 
 
414 aa  247  2e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  39.01 
 
 
425 aa  242  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  38.54 
 
 
434 aa  239  1e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  40.37 
 
 
423 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  40.25 
 
 
435 aa  232  7.000000000000001e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  39.13 
 
 
433 aa  230  3e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  38.29 
 
 
441 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  39.95 
 
 
414 aa  228  1e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  34.82 
 
 
410 aa  208  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  32.65 
 
 
390 aa  204  3e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  33.8 
 
 
410 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  34.95 
 
 
405 aa  187  4e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  33.85 
 
 
412 aa  180  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  36.38 
 
 
420 aa  178  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  34.03 
 
 
460 aa  176  9e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  34.54 
 
 
407 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  33.42 
 
 
414 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  34.96 
 
 
412 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  32.23 
 
 
435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  36.1 
 
 
440 aa  155  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  35.77 
 
 
387 aa  153  4e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  36.46 
 
 
419 aa  153  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  30.17 
 
 
404 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  35.56 
 
 
440 aa  150  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  35.79 
 
 
420 aa  149  6e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  32.08 
 
 
330 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  32.65 
 
 
430 aa  146  5e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  32.03 
 
 
411 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  33.15 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  36.45 
 
 
430 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  32.84 
 
 
435 aa  140  3e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  35 
 
 
409 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  35.29 
 
 
387 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  35.96 
 
 
420 aa  127  4.0000000000000003e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  31.28 
 
 
431 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  28.6 
 
 
426 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  31.45 
 
 
418 aa  107  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  28.65 
 
 
408 aa  104  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  28.32 
 
 
417 aa  102  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  30.25 
 
 
429 aa  101  2e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  30.52 
 
 
407 aa  99.4  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4226  hypothetical protein  92.16 
 
 
141 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  34.6 
 
 
431 aa  96.3  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.09 
 
 
411 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  25.78 
 
 
429 aa  89.4  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  27.68 
 
 
432 aa  89  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  28.18 
 
 
405 aa  89  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  29.68 
 
 
419 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  29.68 
 
 
419 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.27 
 
 
431 aa  86.7  7e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  25.47 
 
 
429 aa  85.5  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  26.72 
 
 
380 aa  84  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  29.33 
 
 
419 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  31.58 
 
 
152 aa  81.3  0.00000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.26 
 
 
439 aa  79  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  28.62 
 
 
419 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  24.02 
 
 
433 aa  79.3  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  29.97 
 
 
444 aa  79.3  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  28.84 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  30.12 
 
 
418 aa  76.3  0.0000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25.41 
 
 
392 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  28.77 
 
 
449 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.75 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  28.12 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.5 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  25.54 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  31.06 
 
 
318 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  27.17 
 
 
395 aa  71.6  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  36.51 
 
 
295 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  28.13 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  31.93 
 
 
443 aa  71.6  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  25.06 
 
 
433 aa  72  0.00000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.32 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  24.69 
 
 
435 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.84 
 
 
460 aa  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  28.4 
 
 
312 aa  65.1  0.000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  27.05 
 
 
425 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  31.63 
 
 
430 aa  61.6  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  31.13 
 
 
312 aa  60.8  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  26.71 
 
 
318 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  25.12 
 
 
432 aa  60.8  0.00000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  24.02 
 
 
435 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  21.2 
 
 
438 aa  60.1  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  27.56 
 
 
318 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  27.01 
 
 
448 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.27 
 
 
430 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  27.04 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  25.62 
 
 
434 aa  57  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  25.62 
 
 
434 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  25.12 
 
 
400 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>