133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7391 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  81.93 
 
 
415 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  89.59 
 
 
414 aa  758    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  100 
 
 
415 aa  834    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  70.6 
 
 
415 aa  597  1e-169  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  68.67 
 
 
415 aa  587  1e-166  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  61.93 
 
 
415 aa  495  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  44.06 
 
 
418 aa  311  1e-83  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  39.8 
 
 
414 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  39.85 
 
 
421 aa  252  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  39.11 
 
 
434 aa  241  2e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  37.89 
 
 
414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  40.69 
 
 
423 aa  239  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  38.58 
 
 
441 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  35.27 
 
 
425 aa  219  7e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  37.41 
 
 
433 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  38.52 
 
 
435 aa  218  1e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  39.78 
 
 
414 aa  209  5e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  34.29 
 
 
410 aa  202  6e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  34.89 
 
 
410 aa  194  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  30.6 
 
 
390 aa  190  5e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  32.58 
 
 
405 aa  182  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  34.8 
 
 
420 aa  179  5.999999999999999e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 
460 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  34.21 
 
 
435 aa  172  7.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  32.89 
 
 
412 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  35.15 
 
 
414 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  35.25 
 
 
412 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  31.6 
 
 
407 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  33.15 
 
 
411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  32.59 
 
 
430 aa  150  3e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  34.03 
 
 
387 aa  150  5e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  31.13 
 
 
435 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  32.72 
 
 
419 aa  143  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  34.2 
 
 
420 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  32.53 
 
 
440 aa  140  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  31.76 
 
 
440 aa  140  6e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  35.31 
 
 
409 aa  139  1e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  32.8 
 
 
431 aa  138  2e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  30.71 
 
 
430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  30.22 
 
 
387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  28.96 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  30.79 
 
 
430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  30.72 
 
 
330 aa  125  9e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  34.77 
 
 
420 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  30.03 
 
 
408 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  31.22 
 
 
417 aa  110  5e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  30.67 
 
 
429 aa  106  7e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  29.83 
 
 
407 aa  105  1e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4226  hypothetical protein  76.67 
 
 
141 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  25.92 
 
 
426 aa  90.9  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  30.24 
 
 
431 aa  90.5  5e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  29.33 
 
 
418 aa  88.2  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  29.82 
 
 
431 aa  87  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  26.67 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 
419 aa  86.7  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  28.33 
 
 
405 aa  85.1  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.7 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  29.19 
 
 
419 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  28.65 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  29.97 
 
 
444 aa  80.5  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  28.9 
 
 
419 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  32.35 
 
 
152 aa  80.1  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  26.27 
 
 
429 aa  79  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  26.3 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  27 
 
 
433 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  23.74 
 
 
429 aa  76.3  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  28.35 
 
 
432 aa  72.8  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  31.9 
 
 
419 aa  71.6  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  25.51 
 
 
424 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  27.03 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  27.65 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  25.14 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.14 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  36.29 
 
 
295 aa  67.8  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
391 aa  66.2  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  27.19 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.43 
 
 
418 aa  65.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  33.06 
 
 
318 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  33.06 
 
 
318 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  31.93 
 
 
443 aa  64.3  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  28.79 
 
 
439 aa  63.5  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  27.11 
 
 
392 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  23.45 
 
 
435 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  25.57 
 
 
395 aa  60.1  0.00000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  26.96 
 
 
432 aa  60.1  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  28.67 
 
 
317 aa  59.7  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  25.22 
 
 
312 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  26.94 
 
 
448 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  26.82 
 
 
433 aa  57.4  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  30.43 
 
 
453 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  25 
 
 
318 aa  56.2  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  28.19 
 
 
447 aa  55.8  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  26.05 
 
 
462 aa  55.8  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  29.27 
 
 
305 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  27.99 
 
 
433 aa  54.3  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  26.11 
 
 
420 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  26.67 
 
 
312 aa  52.8  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  26.11 
 
 
420 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  28.15 
 
 
420 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  31.33 
 
 
418 aa  52.4  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>