111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3419 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  100 
 
 
425 aa  835    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  39.01 
 
 
415 aa  242  9e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  37.99 
 
 
415 aa  239  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  38.28 
 
 
418 aa  229  1e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  42.69 
 
 
414 aa  228  1e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  36.1 
 
 
415 aa  224  2e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  35.27 
 
 
415 aa  219  7.999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  34.3 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  38.08 
 
 
415 aa  216  5e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  35.08 
 
 
433 aa  193  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  35.4 
 
 
434 aa  186  8e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  31.72 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  32.72 
 
 
441 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  31.93 
 
 
414 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  34.43 
 
 
414 aa  175  1.9999999999999998e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  35.73 
 
 
435 aa  172  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  34.62 
 
 
405 aa  170  5e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  37.91 
 
 
423 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  33.51 
 
 
410 aa  159  6e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  34.52 
 
 
410 aa  156  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  34.21 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  29.02 
 
 
390 aa  151  2e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  32.38 
 
 
412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  32.09 
 
 
412 aa  133  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  29.82 
 
 
419 aa  132  9e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  31.19 
 
 
407 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  30.15 
 
 
430 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  30.83 
 
 
387 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  29.35 
 
 
409 aa  126  7e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  30.98 
 
 
430 aa  125  1e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  30.16 
 
 
411 aa  124  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  29.09 
 
 
430 aa  124  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  29.37 
 
 
435 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  29.59 
 
 
330 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  27.2 
 
 
440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  28.2 
 
 
460 aa  113  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  25.07 
 
 
420 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  35.31 
 
 
420 aa  112  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  29.98 
 
 
431 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  29.04 
 
 
420 aa  109  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  29.86 
 
 
407 aa  108  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  28.54 
 
 
408 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  26.86 
 
 
440 aa  107  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  30.42 
 
 
387 aa  106  7e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  29.9 
 
 
435 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.11 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  34.08 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  29.44 
 
 
417 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  29.75 
 
 
429 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  26.55 
 
 
418 aa  81.6  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  25.4 
 
 
434 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  30.68 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  24.02 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  31.11 
 
 
405 aa  77.4  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  25.79 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  21.12 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  26.04 
 
 
439 aa  70.9  0.00000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  27.17 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  24.64 
 
 
432 aa  69.7  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  25.68 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  25.92 
 
 
435 aa  68.9  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  31.46 
 
 
295 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  26.39 
 
 
449 aa  68.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  29.71 
 
 
152 aa  67  0.0000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  24.35 
 
 
435 aa  65.9  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.92 
 
 
418 aa  62.8  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  24.27 
 
 
433 aa  62  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 
429 aa  61.2  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 
419 aa  60.1  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  26.88 
 
 
431 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  27.81 
 
 
448 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  27.16 
 
 
433 aa  57.8  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  25.7 
 
 
430 aa  56.6  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  27.43 
 
 
419 aa  56.6  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  23.65 
 
 
392 aa  55.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  28.42 
 
 
410 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.04 
 
 
434 aa  55.5  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  26.01 
 
 
429 aa  54.7  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.51 
 
 
434 aa  54.3  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  22.56 
 
 
312 aa  53.9  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  25.71 
 
 
460 aa  53.5  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  27.05 
 
 
443 aa  53.5  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  24.29 
 
 
418 aa  52.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
391 aa  53.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  24.31 
 
 
251 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  27.45 
 
 
432 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.79 
 
 
434 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.79 
 
 
434 aa  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  26.96 
 
 
414 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  28.57 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.87 
 
 
419 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  22.69 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.4 
 
 
433 aa  50.4  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.92 
 
 
430 aa  50.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4226  hypothetical protein  43.14 
 
 
141 aa  48.9  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.98 
 
 
430 aa  48.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  24 
 
 
402 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  26.98 
 
 
422 aa  45.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  29.06 
 
 
419 aa  45.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>