124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4227 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  74.4 
 
 		 431 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  90.45 
 
 		 419 aa  791    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  96.65 
 
 		 419 aa  836    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  90.45 
 
 		 419 aa  791    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 419 aa  864    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  50.14 
 
 		 391 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  40.05 
 
 		 418 aa  293  3e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  33.65 
 
 		 433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  31.13 
 
 		 380 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  30.05 
 
 		 429 aa  169  1e-40  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  34.24 
 
 		 419 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  29.88 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  29.13 
 
 		 433 aa  166  8e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  30.21 
 
 		 424 aa  166  8e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  33.9 
 
 		 429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 		 444 aa  164  2.0000000000000002e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  30.98 
 
 		 432 aa  163  5.0000000000000005e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  28.94 
 
 		 433 aa  163  5.0000000000000005e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  29.91 
 
 		 449 aa  163  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  31.11 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  33.89 
 
 		 418 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  31.11 
 
 		 435 aa  157  4e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  34.28 
 
 		 411 aa  155  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  32.28 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  29.75 
 
 		 392 aa  150  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  27.99 
 
 		 439 aa  149  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  29.26 
 
 		 426 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  26.65 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  123  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  26.78 
 
 		 412 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  27.67 
 
 		 414 aa  94  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  29.66 
 
 		 414 aa  90.5  5e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 		 420 aa  87.8  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  26.07 
 
 		 421 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  28.98 
 
 		 415 aa  85.1  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  26.59 
 
 		 423 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  26.07 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  29.27 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  27.78 
 
 		 430 aa  80.5  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  28.9 
 
 		 415 aa  80.5  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  28.62 
 
 		 415 aa  79.3  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  27.7 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  28.41 
 
 		 415 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  27.54 
 
 		 410 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  31.27 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  26.49 
 
 		 460 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 409 aa  73.2  0.000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  25.93 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25.61 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  27.02 
 
 		 405 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.68 
 
 		 404 aa  70.5  0.00000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  28.07 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.06 
 
 		 410 aa  69.7  0.00000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  24.44 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  25.65 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  24.07 
 
 		 408 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  27.85 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  25.85 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  26.17 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  25.73 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  23.84 
 
 		 440 aa  67  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  43.42 
 
 		 120 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  27.49 
 
 		 435 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  27.3 
 
 		 419 aa  64.7  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  28.25 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  23.46 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  27.97 
 
 		 387 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  23.53 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  26.43 
 
 		 414 aa  61.2  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  24.37 
 
 		 457 aa  60.1  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  25.74 
 
 		 441 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  25.5 
 
 		 412 aa  59.3  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  26.09 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  30.3 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  22.76 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  27.38 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  27.38 
 
 		 420 aa  53.9  0.000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  27.17 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  25.45 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  24.32 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  27.11 
 
 		 420 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  27.87 
 
 		 425 aa  51.6  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  24.6 
 
 		 429 aa  51.6  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  26.97 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  28.57 
 
 		 404 aa  50.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  27.22 
 
 		 437 aa  50.4  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  31.52 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  26.9 
 
 		 400 aa  49.7  0.00009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  26.32 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  26.32 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  26.61 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  26.21 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  27.76 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  24.26 
 
 		 433 aa  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  26.95 
 
 		 417 aa  48.1  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  26.28 
 
 		 437 aa  48.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  24.05 
 
 		 427 aa  47.8  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  26.7 
 
 		 318 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  27.03 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  26.67 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>