124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_4331 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  75.36 
 
 
431 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  100 
 
 
419 aa  865    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  91.39 
 
 
419 aa  795    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  100 
 
 
419 aa  865    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  90.45 
 
 
419 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  48.18 
 
 
391 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  40.28 
 
 
418 aa  293  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  33.17 
 
 
433 aa  189  8e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  31.47 
 
 
380 aa  181  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  35.4 
 
 
419 aa  174  2.9999999999999996e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  30.5 
 
 
424 aa  169  6e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  32.66 
 
 
429 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  29.98 
 
 
449 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  33.51 
 
 
444 aa  167  4e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  29.15 
 
 
429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  33.05 
 
 
411 aa  161  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  28.99 
 
 
430 aa  160  6e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  33.06 
 
 
435 aa  159  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  31.69 
 
 
435 aa  158  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  33.71 
 
 
418 aa  157  3e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  27.49 
 
 
433 aa  156  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  30.15 
 
 
432 aa  155  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  29.8 
 
 
439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  28.01 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  30.3 
 
 
430 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  29.32 
 
 
392 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  26.89 
 
 
434 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  29.38 
 
 
426 aa  138  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  32.81 
 
 
295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  27.3 
 
 
412 aa  96.7  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  30.92 
 
 
420 aa  96.7  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30.89 
 
 
414 aa  96.7  8e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  27.46 
 
 
414 aa  92  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  29.68 
 
 
415 aa  89.4  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  27.1 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  29.68 
 
 
415 aa  87.4  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  27.46 
 
 
421 aa  87  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  26.67 
 
 
415 aa  86.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  28.45 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  29.43 
 
 
415 aa  82.4  0.00000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  26.33 
 
 
423 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  31.27 
 
 
415 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  28.61 
 
 
409 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  29.21 
 
 
410 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  29.67 
 
 
411 aa  77  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.76 
 
 
404 aa  75.9  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  27.95 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  28.15 
 
 
405 aa  74.7  0.000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  27.46 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  27.12 
 
 
460 aa  73.2  0.000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  24.8 
 
 
408 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  26.42 
 
 
407 aa  72  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  23.19 
 
 
420 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.06 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  28.71 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  27.76 
 
 
412 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  24.88 
 
 
440 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  26.27 
 
 
407 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25.18 
 
 
430 aa  67  0.0000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  25.22 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  26.16 
 
 
430 aa  67  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  24.57 
 
 
435 aa  66.6  0.0000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  28.11 
 
 
387 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  23.94 
 
 
440 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  24.29 
 
 
457 aa  65.1  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  43.42 
 
 
120 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  27.56 
 
 
435 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  26.52 
 
 
387 aa  64.3  0.000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  26.33 
 
 
419 aa  62  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  26.73 
 
 
434 aa  61.6  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  26.43 
 
 
414 aa  61.6  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  25.74 
 
 
441 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  27.98 
 
 
420 aa  57.8  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  27.98 
 
 
420 aa  57.4  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  27.98 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  27.98 
 
 
420 aa  57  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  23.17 
 
 
433 aa  56.2  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 
420 aa  55.8  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  24.83 
 
 
435 aa  55.5  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  27.49 
 
 
400 aa  53.9  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  26.3 
 
 
429 aa  53.9  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  28.57 
 
 
404 aa  53.9  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  27.54 
 
 
431 aa  52  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  24.74 
 
 
430 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  24.83 
 
 
410 aa  51.2  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  28.57 
 
 
425 aa  51.6  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  22.01 
 
 
312 aa  51.2  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  28.48 
 
 
417 aa  50.8  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  25.45 
 
 
330 aa  51.2  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  28.03 
 
 
152 aa  50.8  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  29 
 
 
418 aa  50.4  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  24.17 
 
 
318 aa  50.1  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  24.43 
 
 
427 aa  49.3  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  25.28 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  25 
 
 
418 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  24.93 
 
 
412 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  24.65 
 
 
318 aa  47.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.08 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 
434 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.35 
 
 
435 aa  47.4  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>