83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0502 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  100 
 
 		 430 aa  886    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  49.88 
 
 		 426 aa  427  1e-118  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  33.11 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  33.11 
 
 		 438 aa  251  2e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  33.25 
 
 		 436 aa  198  1.0000000000000001e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2916  HipA domain-containing protein  32.19 
 
 		 448 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.615087  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3170  hypothetical protein  31.9 
 
 		 455 aa  170  5e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0340  hypothetical protein  30.59 
 
 		 456 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0883  HipA domain-containing protein  30.66 
 
 		 457 aa  149  8e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.732882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  31.13 
 
 		 448 aa  147  3e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3691  HipA domain-containing protein  28.79 
 
 		 449 aa  143  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.521497  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0258  hypothetical protein  35.96 
 
 		 141 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000478609  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  23.71 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  24.57 
 
 		 425 aa  64.3  0.000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  34.39 
 
 		 460 aa  62.4  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  26.18 
 
 		 435 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  33.01 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  26.15 
 
 		 414 aa  58.5  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  32.8 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  29.07 
 
 		 440 aa  58.2  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  33.13 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  27.04 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  26.86 
 
 		 431 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  24.77 
 
 		 421 aa  57  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  25.26 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  26.83 
 
 		 449 aa  56.2  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  27.52 
 
 		 440 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  29.85 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  29.37 
 
 		 420 aa  56.2  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  31.73 
 
 		 412 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30.61 
 
 		 410 aa  53.5  0.000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  30.6 
 
 		 430 aa  53.1  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  32.46 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  29.33 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  29 
 
 		 423 aa  52.4  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  51.6  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  33.06 
 
 		 415 aa  52  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  29.25 
 
 		 410 aa  51.2  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  23.84 
 
 		 433 aa  51.2  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  31.58 
 
 		 414 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  27.45 
 
 		 419 aa  51.2  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  23.37 
 
 		 429 aa  50.8  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  30.3 
 
 		 420 aa  50.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  31.1 
 
 		 433 aa  50.4  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  24.02 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  30.7 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  30.87 
 
 		 430 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  25.28 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  27.09 
 
 		 447 aa  48.5  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  25.28 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  23.75 
 
 		 451 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  25.32 
 
 		 418 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  27.61 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  25.23 
 
 		 312 aa  47.4  0.0004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  29.57 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  30.63 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  30.12 
 
 		 395 aa  47  0.0007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  30.2 
 
 		 435 aa  47  0.0007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  22.71 
 
 		 414 aa  46.6  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  28.4 
 
 		 429 aa  45.8  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  28.1 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  28.86 
 
 		 295 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  22.58 
 
 		 418 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  27.12 
 
 		 419 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  29.13 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  29.13 
 
 		 415 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  27.64 
 
 		 429 aa  45.1  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  24.34 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  22.01 
 
 		 430 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  24.47 
 
 		 431 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28.09 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  23.79 
 
 		 437 aa  45.1  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  28 
 
 		 152 aa  44.7  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  23.72 
 
 		 433 aa  44.3  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  25.81 
 
 		 613 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  28.17 
 
 		 411 aa  44.7  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  27.84 
 
 		 424 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.76 
 
 		 435 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  26.73 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  23.34 
 
 		 437 aa  43.9  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  27.63 
 
 		 407 aa  43.9  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  26.73 
 
 		 435 aa  43.9  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  26.88 
 
 		 422 aa  43.1  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>