31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0883 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0883  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 457 aa  939    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.732882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0870  HipA domain protein  59.91 
 
 		 448 aa  534  1e-150  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.379459  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3691  HipA domain-containing protein  58.22 
 
 		 449 aa  512  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.521497  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2916  HipA domain-containing protein  57.78 
 
 		 448 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.615087  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0340  hypothetical protein  57.89 
 
 		 456 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3170  hypothetical protein  47.17 
 
 		 455 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31080  hypothetical protein  33.92 
 
 		 436 aa  206  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2517  HipA domain protein  32.33 
 
 		 426 aa  189  9e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0212524  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0502  hypothetical protein  30.66 
 
 		 430 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5379  HipA-like  31.56 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5482  HipA domain-containing protein  31.56 
 
 		 438 aa  159  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.639986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  25.1 
 
 		 387 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  25.62 
 
 		 430 aa  51.2  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  23.83 
 
 		 419 aa  50.4  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  25.85 
 
 		 440 aa  50.1  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25.51 
 
 		 430 aa  49.7  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  38.55 
 
 		 431 aa  49.7  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  24.62 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  24.81 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  26.06 
 
 		 414 aa  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  23.94 
 
 		 412 aa  47.8  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  30.5 
 
 		 435 aa  47.4  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  24.54 
 
 		 422 aa  47  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  25.35 
 
 		 451 aa  46.2  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  25.53 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  25.14 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3613  HipA domain protein  27.4 
 
 		 443 aa  46.2  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  37.29 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0258  hypothetical protein  25.96 
 
 		 141 aa  43.5  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000478609  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  27.33 
 
 		 420 aa  43.5  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  26.55 
 
 		 437 aa  43.1  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>