22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3613 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3613  HipA domain protein  100 
 
 		 443 aa  912    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  45.74 
 
 		 447 aa  378  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4986  hypothetical protein  54.4 
 
 		 319 aa  354  2e-96  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2168  hypothetical protein  37.11 
 
 		 430 aa  247  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3571  hypothetical protein  39.69 
 
 		 468 aa  247  3e-64  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1570  hypothetical protein  37.33 
 
 		 451 aa  247  4e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  36.26 
 
 		 462 aa  243  6e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  35.19 
 
 		 443 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4855  hypothetical protein  37.7 
 
 		 452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.874241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  25.12 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  23.57 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  26.3 
 
 		 415 aa  55.8  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.53 
 
 		 439 aa  52.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  24.92 
 
 		 392 aa  50.1  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  22.79 
 
 		 415 aa  47  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.39 
 
 		 441 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  24.16 
 
 		 387 aa  45.4  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  24.73 
 
 		 312 aa  45.4  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  23.2 
 
 		 409 aa  44.3  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  31.31 
 
 		 416 aa  43.9  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  26.67 
 
 		 387 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>