13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4855 on replicon NC_008759
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_1570  hypothetical protein  85.75 
 
 
451 aa  758    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4855  hypothetical protein  100 
 
 
452 aa  904    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.874241  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2168  hypothetical protein  68.26 
 
 
430 aa  539  9.999999999999999e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  39.21 
 
 
447 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3613  HipA domain protein  37.7 
 
 
443 aa  251  2e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  40.09 
 
 
462 aa  240  4e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3571  hypothetical protein  39.96 
 
 
468 aa  232  9e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  37.8 
 
 
443 aa  212  1e-53  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4986  hypothetical protein  35.74 
 
 
319 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  32.22 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  28.9 
 
 
415 aa  44.3  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30.46 
 
 
414 aa  43.5  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  29.55 
 
 
420 aa  43.1  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>