23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4986 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A4986  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  650    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3613  HipA domain protein  54.4 
 
 		 443 aa  354  1e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0664  hypothetical protein  44.94 
 
 		 447 aa  250  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2168  hypothetical protein  39.39 
 
 		 430 aa  190  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.146137 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  38.13 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1570  hypothetical protein  36.48 
 
 		 451 aa  175  7e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3571  hypothetical protein  37.04 
 
 		 468 aa  170  3e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4855  hypothetical protein  35.74 
 
 		 452 aa  161  1e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.874241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0903  hypothetical protein  35.62 
 
 		 462 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  27.15 
 
 		 415 aa  53.1  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  28.05 
 
 		 414 aa  50.4  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  28.05 
 
 		 415 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  24.48 
 
 		 418 aa  47.8  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  26.91 
 
 		 387 aa  46.6  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 411 aa  46.2  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 430 aa  46.2  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  24.26 
 
 		 330 aa  45.4  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  25.26 
 
 		 415 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  26.52 
 
 		 440 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  27.75 
 
 		 420 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  27.46 
 
 		 392 aa  43.9  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  23.4 
 
 		 524 aa  43.1  0.007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  27.12 
 
 		 409 aa  42.7  0.009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>