192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0263 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  86.98 
 
 
430 aa  763    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  100 
 
 
430 aa  880    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  71.5 
 
 
387 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  64.79 
 
 
419 aa  554  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  61.43 
 
 
440 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  59.81 
 
 
440 aa  532  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  59.42 
 
 
387 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  49.52 
 
 
420 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  47.09 
 
 
411 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  34.81 
 
 
412 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  35.77 
 
 
412 aa  207  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  35.51 
 
 
420 aa  208  2e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  36.1 
 
 
435 aa  205  2e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  34.57 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  34.62 
 
 
430 aa  192  1e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  33.33 
 
 
407 aa  182  1e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  32.51 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  38.42 
 
 
420 aa  166  1.0000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  31.67 
 
 
431 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  31.44 
 
 
404 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  34.32 
 
 
429 aa  158  2e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  33.15 
 
 
415 aa  150  4e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  30.99 
 
 
330 aa  149  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  34.52 
 
 
415 aa  145  2e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  30.46 
 
 
431 aa  143  6e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30 
 
 
414 aa  143  7e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  32.91 
 
 
418 aa  142  9e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  29.86 
 
 
421 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  30.53 
 
 
415 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  30.13 
 
 
407 aa  137  4e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  30.18 
 
 
415 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  32.92 
 
 
417 aa  136  7.000000000000001e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  30.17 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  30.15 
 
 
425 aa  132  9e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  34.52 
 
 
435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  32.02 
 
 
434 aa  129  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  35 
 
 
414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  32.79 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  28.93 
 
 
409 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30.87 
 
 
410 aa  125  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  28.61 
 
 
408 aa  124  3e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  30.88 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  30.62 
 
 
423 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  29.41 
 
 
414 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  28.8 
 
 
415 aa  116  6e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  27.62 
 
 
410 aa  110  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  32.18 
 
 
414 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  31.62 
 
 
433 aa  103  6e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  28.31 
 
 
405 aa  99.4  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.74 
 
 
433 aa  98.2  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  27.21 
 
 
432 aa  92  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  28.23 
 
 
418 aa  91.7  3e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  29.95 
 
 
414 aa  90.1  6e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  24.67 
 
 
434 aa  86.3  9e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  28.12 
 
 
444 aa  84.3  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  25.92 
 
 
433 aa  84.3  0.000000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  25.83 
 
 
435 aa  83.2  0.000000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  26.01 
 
 
429 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  27.54 
 
 
430 aa  80.1  0.00000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  24.47 
 
 
430 aa  79  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  25.52 
 
 
426 aa  79.7  0.0000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  23.1 
 
 
392 aa  77.8  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  32.75 
 
 
460 aa  76.3  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  28.47 
 
 
419 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  27.33 
 
 
411 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  27.95 
 
 
433 aa  73.6  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  25.44 
 
 
439 aa  73.6  0.000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  27.74 
 
 
443 aa  72.8  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  26.57 
 
 
419 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  26.18 
 
 
418 aa  72  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  28.46 
 
 
382 aa  72  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  27.91 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  25.18 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  25.18 
 
 
419 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  28.07 
 
 
431 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  25.72 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  25.72 
 
 
435 aa  66.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  25.74 
 
 
380 aa  64.7  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  27 
 
 
391 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.25 
 
 
433 aa  63.5  0.000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  25.57 
 
 
431 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  28.72 
 
 
432 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  26.88 
 
 
429 aa  61.6  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  26.24 
 
 
423 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.24 
 
 
433 aa  60.5  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  26.85 
 
 
422 aa  60.1  0.00000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  32.65 
 
 
295 aa  59.7  0.00000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.7 
 
 
433 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  25.33 
 
 
395 aa  59.3  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  27.27 
 
 
312 aa  58.9  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  26.43 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  30.71 
 
 
430 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  26.74 
 
 
449 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  26.17 
 
 
437 aa  58.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.48 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.7 
 
 
433 aa  58.9  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  31.18 
 
 
435 aa  58.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2310  hypothetical protein  55.1 
 
 
80 aa  57.8  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.164046 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  25.07 
 
 
424 aa  58.2  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>