77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0482 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  100 
 
 		 524 aa  1058    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  35.4 
 
 		 527 aa  276  5e-73  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  31.88 
 
 		 526 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  26.43 
 
 		 403 aa  79  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  29.89 
 
 		 312 aa  77.8  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.76 
 
 		 408 aa  77  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  25.13 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  25.39 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  26.43 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  25.26 
 
 		 418 aa  71.6  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  26.17 
 
 		 305 aa  70.5  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  34.21 
 
 		 318 aa  67  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  25.22 
 
 		 617 aa  64.7  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  23.76 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  31.21 
 
 		 251 aa  61.6  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  26.21 
 
 		 395 aa  61.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  32.54 
 
 		 449 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  25.24 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  25.24 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.2 
 
 		 439 aa  60.8  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  27.06 
 
 		 613 aa  59.7  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  24.88 
 
 		 438 aa  58.5  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  27.27 
 
 		 410 aa  58.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  27.14 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  23.4 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  23.53 
 
 		 430 aa  57.4  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  24.93 
 
 		 435 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  23.11 
 
 		 413 aa  54.7  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  21.81 
 
 		 382 aa  54.7  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0858  hypothetical protein  38.14 
 
 		 111 aa  54.7  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215175 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  22.14 
 
 		 422 aa  54.7  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  19.47 
 
 		 432 aa  53.5  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  20.17 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  24.53 
 
 		 381 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  23.03 
 
 		 449 aa  52  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 		 440 aa  52  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.11 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  22.22 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  24.64 
 
 		 411 aa  51.2  0.00005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  29.34 
 
 		 460 aa  50.4  0.00007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  28.45 
 
 		 620 aa  50.4  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  28.57 
 
 		 414 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  25.86 
 
 		 437 aa  50.1  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  28.24 
 
 		 392 aa  50.4  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0495  hypothetical protein  33.33 
 
 		 109 aa  49.7  0.0001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2291  hypothetical protein  35.71 
 
 		 102 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  22.38 
 
 		 450 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  29.17 
 
 		 400 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  27.54 
 
 		 430 aa  48.1  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  22.51 
 
 		 380 aa  48.1  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  25 
 
 		 433 aa  47.8  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  22.13 
 
 		 435 aa  47.8  0.0005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  28.91 
 
 		 407 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  28.12 
 
 		 404 aa  47.4  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  22.55 
 
 		 435 aa  47  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  22.98 
 
 		 427 aa  46.2  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  21.21 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  21.21 
 
 		 434 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  21.86 
 
 		 439 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  20.56 
 
 		 450 aa  46.2  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  25.15 
 
 		 413 aa  45.8  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  23.39 
 
 		 426 aa  45.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  21.61 
 
 		 434 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  21.51 
 
 		 427 aa  45.8  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  22.85 
 
 		 433 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  20.17 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  21.79 
 
 		 416 aa  44.7  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  24.84 
 
 		 434 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  35.42 
 
 		 396 aa  44.3  0.006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  22.99 
 
 		 456 aa  44.3  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  26.74 
 
 		 454 aa  43.9  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0152  HipA N-terminal domain protein  31.73 
 
 		 109 aa  44.3  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  29.13 
 
 		 446 aa  43.9  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  20.98 
 
 		 447 aa  43.9  0.008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  21.1 
 
 		 480 aa  43.9  0.008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  25.6 
 
 		 433 aa  43.9  0.008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  25.66 
 
 		 418 aa  43.5  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>