48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0495 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0495  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  224  2e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0858  hypothetical protein  57.84 
 
 		 111 aa  123  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215175 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0152  HipA N-terminal domain protein  56.86 
 
 		 109 aa  120  4e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2167  HipA N-terminal domain protein  52.94 
 
 		 107 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0107029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0211  HipA N-terminal domain protein  50.5 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0248  hypothetical protein  49.5 
 
 		 107 aa  112  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  39.39 
 
 		 408 aa  72  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0402  hypothetical protein  37.63 
 
 		 96 aa  68.6  0.00000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  41.75 
 
 		 435 aa  66.6  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  36.63 
 
 		 409 aa  65.5  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2291  hypothetical protein  37.86 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  35.64 
 
 		 418 aa  62.8  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  33 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  40.51 
 
 		 419 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  33.33 
 
 		 524 aa  49.7  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  28 
 
 		 222 aa  48.9  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  27 
 
 		 435 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  28.97 
 
 		 426 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  33.65 
 
 		 444 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  34.48 
 
 		 449 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  30.85 
 
 		 437 aa  47  0.00008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  27.91 
 
 		 441 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  26.53 
 
 		 440 aa  45.4  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28.41 
 
 		 422 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  31.96 
 
 		 403 aa  45.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  30.16 
 
 		 438 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  27 
 
 		 439 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  37.1 
 
 		 435 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  24 
 
 		 382 aa  44.3  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  26.73 
 
 		 116 aa  44.7  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  25.49 
 
 		 439 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  27.36 
 
 		 434 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  31.34 
 
 		 441 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  25.74 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  25.74 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  25.74 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  30.77 
 
 		 449 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  30.1 
 
 		 450 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  25.74 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  25.74 
 
 		 440 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  25.49 
 
 		 440 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  27.5 
 
 		 450 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  30.93 
 
 		 402 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  31 
 
 		 414 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  36.76 
 
 		 449 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 453 aa  40.4  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  25.53 
 
 		 435 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  33.33 
 
 		 453 aa  40  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>