78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0858 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0858  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  233  9e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000215175 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2167  HipA N-terminal domain protein  53.85 
 
 		 107 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0107029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0152  HipA N-terminal domain protein  57.01 
 
 		 109 aa  130  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0211  HipA N-terminal domain protein  53.85 
 
 		 107 aa  128  3e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0248  hypothetical protein  52.88 
 
 		 107 aa  125  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0495  hypothetical protein  57.84 
 
 		 109 aa  123  7e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2291  hypothetical protein  38.1 
 
 		 102 aa  77  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0402  hypothetical protein  41.3 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  39.25 
 
 		 408 aa  67  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  34.83 
 
 		 441 aa  63.9  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  33.72 
 
 		 116 aa  62.4  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  32.29 
 
 		 382 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  38.89 
 
 		 449 aa  59.3  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  38.46 
 
 		 419 aa  57.4  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  34.38 
 
 		 414 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  32.11 
 
 		 435 aa  56.2  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  36 
 
 		 435 aa  55.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  38.14 
 
 		 524 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  28.16 
 
 		 434 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  27.93 
 
 		 222 aa  52.8  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.32 
 
 		 422 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  27.18 
 
 		 439 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  29.36 
 
 		 440 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  29.36 
 
 		 440 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  29.36 
 
 		 440 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  29.36 
 
 		 440 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  29.36 
 
 		 440 aa  50.8  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.71 
 
 		 430 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  28.16 
 
 		 441 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  30.39 
 
 		 439 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  32.43 
 
 		 409 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  33.33 
 
 		 418 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  34.09 
 
 		 435 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  28.42 
 
 		 450 aa  49.3  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  32.93 
 
 		 437 aa  49.3  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  32.22 
 
 		 440 aa  49.3  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  36.17 
 
 		 451 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  27.88 
 
 		 444 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  30.69 
 
 		 439 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  31.58 
 
 		 434 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  31.58 
 
 		 434 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  29.47 
 
 		 435 aa  47.4  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  25 
 
 		 622 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  43.94 
 
 		 402 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  34.04 
 
 		 449 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  38.75 
 
 		 403 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  29.41 
 
 		 438 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  29.81 
 
 		 433 aa  45.4  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  25 
 
 		 450 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  25 
 
 		 450 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  25 
 
 		 450 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  25 
 
 		 450 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  25 
 
 		 450 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  25 
 
 		 450 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  29.21 
 
 		 440 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  36.17 
 
 		 449 aa  45.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  31.25 
 
 		 435 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  31.73 
 
 		 396 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  27.43 
 
 		 440 aa  44.7  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  30.85 
 
 		 445 aa  44.7  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 446 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 446 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  30 
 
 		 446 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 450 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.73 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  34.52 
 
 		 435 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  34.52 
 
 		 435 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  29.47 
 
 		 434 aa  43.5  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  30 
 
 		 446 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  29.47 
 
 		 434 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  33.33 
 
 		 480 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  30.7 
 
 		 395 aa  42.7  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  38.81 
 
 		 444 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  31.58 
 
 		 404 aa  42  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  29.41 
 
 		 461 aa  41.2  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 		 450 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 444 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 444 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>