139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3807 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  91.22 
 
 		 446 aa  807    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  69.53 
 
 		 444 aa  637    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  88.51 
 
 		 446 aa  786    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 444 aa  899    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  88.74 
 
 		 446 aa  790    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  88.26 
 
 		 444 aa  801    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  88.06 
 
 		 446 aa  788    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  99.55 
 
 		 444 aa  895    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  70.14 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  70.14 
 
 		 622 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  70.14 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  70.14 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  70.14 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  70.14 
 
 		 450 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  58.28 
 
 		 442 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  66.58 
 
 		 380 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  58.99 
 
 		 444 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  54.38 
 
 		 440 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  52.57 
 
 		 450 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  50.11 
 
 		 441 aa  431  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  51.02 
 
 		 447 aa  423  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  49.55 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  52.4 
 
 		 445 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  50.45 
 
 		 446 aa  414  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  51.47 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  48.53 
 
 		 441 aa  411  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  47.36 
 
 		 439 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  45.5 
 
 		 449 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  50.69 
 
 		 440 aa  392  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  46.33 
 
 		 435 aa  395  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  47.94 
 
 		 445 aa  394  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  47.69 
 
 		 440 aa  389  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  48.74 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  48.74 
 
 		 435 aa  375  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  45.67 
 
 		 434 aa  371  1e-101  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  44.65 
 
 		 439 aa  371  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  44.27 
 
 		 438 aa  365  1e-100  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  44.72 
 
 		 435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  42.89 
 
 		 439 aa  352  1e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  44.37 
 
 		 435 aa  328  8e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  41.71 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  42.92 
 
 		 437 aa  323  3e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  42.59 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  42.59 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  42.59 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  42.59 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  42.59 
 
 		 440 aa  318  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  41.29 
 
 		 433 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  44.49 
 
 		 443 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  43.85 
 
 		 450 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  41.67 
 
 		 351 aa  251  2e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  31.49 
 
 		 435 aa  200  5e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  33.79 
 
 		 426 aa  179  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.45 
 
 		 425 aa  172  1e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  36.39 
 
 		 480 aa  160  6e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  34.48 
 
 		 461 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  33.17 
 
 		 422 aa  155  1e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.75 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.14 
 
 		 414 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  32.96 
 
 		 427 aa  143  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  30.81 
 
 		 411 aa  139  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  31.59 
 
 		 449 aa  135  9.999999999999999e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  33.72 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  38.99 
 
 		 176 aa  119  9.999999999999999e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  32.24 
 
 		 422 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.65 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  29.4 
 
 		 435 aa  106  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.27 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.82 
 
 		 433 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  45.69 
 
 		 222 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  30.86 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  46.15 
 
 		 116 aa  99.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  28.21 
 
 		 450 aa  99.8  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.82 
 
 		 433 aa  97.8  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.03 
 
 		 460 aa  97.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  26.82 
 
 		 435 aa  95.5  2e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  27.21 
 
 		 423 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  28.94 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  26.97 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.97 
 
 		 433 aa  93.2  8e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.98 
 
 		 450 aa  93.2  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.82 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  28.89 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.95 
 
 		 434 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  26.51 
 
 		 362 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.46 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.46 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.1 
 
 		 433 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  29.53 
 
 		 451 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  27.66 
 
 		 451 aa  83.6  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  28.42 
 
 		 437 aa  82.8  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.54 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  29.55 
 
 		 456 aa  80.5  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  28.15 
 
 		 437 aa  80.1  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  25.99 
 
 		 431 aa  79.3  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  27.22 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 434 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 434 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  25.82 
 
 		 430 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.52 
 
 		 418 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>