171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2578 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  886    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 435 aa  886    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  52.18 
 
 		 440 aa  452  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  51.96 
 
 		 446 aa  418  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  50.57 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  51.04 
 
 		 445 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  50.46 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  49.77 
 
 		 446 aa  411  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  47.05 
 
 		 442 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  49.31 
 
 		 446 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  47.36 
 
 		 444 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  49.2 
 
 		 444 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  47.7 
 
 		 444 aa  380  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  48.63 
 
 		 444 aa  376  1e-103  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  48.75 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  46.28 
 
 		 441 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  47.84 
 
 		 446 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  48.74 
 
 		 444 aa  371  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  47.84 
 
 		 446 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  46.7 
 
 		 445 aa  371  1e-101  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  47.59 
 
 		 446 aa  365  1e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  46.58 
 
 		 450 aa  364  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  44.8 
 
 		 449 aa  362  6e-99  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  44.08 
 
 		 439 aa  359  4e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  47.21 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  47.21 
 
 		 622 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  46.98 
 
 		 450 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  46.98 
 
 		 450 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  46.98 
 
 		 450 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  46.98 
 
 		 450 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  45.21 
 
 		 440 aa  353  2.9999999999999997e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  44.21 
 
 		 435 aa  352  8.999999999999999e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  42.6 
 
 		 438 aa  349  6e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  44.44 
 
 		 441 aa  348  8e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  42.53 
 
 		 439 aa  348  1e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  41.72 
 
 		 439 aa  346  4e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  41.38 
 
 		 434 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  45.01 
 
 		 437 aa  336  3.9999999999999995e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  42.14 
 
 		 435 aa  332  6e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  46.6 
 
 		 380 aa  330  3e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  39.14 
 
 		 440 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  42.14 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  42.14 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  42.14 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  42.14 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  42.14 
 
 		 440 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  42.59 
 
 		 433 aa  312  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  42.96 
 
 		 435 aa  312  9e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  44.58 
 
 		 443 aa  307  3e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  43.5 
 
 		 450 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  41.52 
 
 		 351 aa  240  4e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  38.29 
 
 		 461 aa  198  1.0000000000000001e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  34.39 
 
 		 425 aa  197  3e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  30.34 
 
 		 435 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  38.14 
 
 		 414 aa  182  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  31.36 
 
 		 480 aa  174  2.9999999999999996e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  32.35 
 
 		 454 aa  161  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  31.79 
 
 		 427 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  31.53 
 
 		 422 aa  157  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  32.98 
 
 		 426 aa  156  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  34.5 
 
 		 411 aa  156  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  34.43 
 
 		 418 aa  146  6e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.59 
 
 		 382 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  34.96 
 
 		 433 aa  132  9e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  34.19 
 
 		 460 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  31.69 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  31.06 
 
 		 435 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  28.74 
 
 		 433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  30.43 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  29.19 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  29.91 
 
 		 423 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  31.76 
 
 		 422 aa  116  8.999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  30.22 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  29.91 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  31.27 
 
 		 416 aa  114  3e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  28.96 
 
 		 435 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.98 
 
 		 450 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  27.55 
 
 		 434 aa  107  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  35.85 
 
 		 176 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.7 
 
 		 430 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.4 
 
 		 434 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.4 
 
 		 434 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.23 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.23 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  29.55 
 
 		 362 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  31.09 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  32.64 
 
 		 440 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.94 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  27.29 
 
 		 413 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  28.62 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  45.05 
 
 		 222 aa  96.7  8e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  30.81 
 
 		 451 aa  95.9  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  28.08 
 
 		 453 aa  94.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  29.68 
 
 		 419 aa  94  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  26.44 
 
 		 418 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  46.79 
 
 		 116 aa  90.5  5e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  25 
 
 		 431 aa  90.1  7e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  32.04 
 
 		 437 aa  88.6  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  31.69 
 
 		 437 aa  88.2  3e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>