190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2033 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  100 
 
 
435 aa  913    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  51.28 
 
 
439 aa  461  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  50.91 
 
 
434 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  50.93 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  48.26 
 
 
438 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  48.04 
 
 
439 aa  428  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  48.39 
 
 
439 aa  426  1e-118  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  48.49 
 
 
435 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  49.65 
 
 
444 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  47.83 
 
 
442 aa  409  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  46.92 
 
 
444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  49.08 
 
 
444 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  46.33 
 
 
444 aa  394  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  46.33 
 
 
444 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  45.87 
 
 
446 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  44.77 
 
 
446 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  44.77 
 
 
446 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  46.08 
 
 
441 aa  382  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  44.95 
 
 
446 aa  374  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  44.78 
 
 
440 aa  372  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  43.24 
 
 
450 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  43.24 
 
 
450 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  43.24 
 
 
450 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  43.24 
 
 
450 aa  369  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  44.7 
 
 
440 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  44.7 
 
 
440 aa  366  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  44.7 
 
 
440 aa  366  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  44.7 
 
 
440 aa  366  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  43.34 
 
 
622 aa  368  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  45.39 
 
 
447 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  44.44 
 
 
446 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  44.7 
 
 
440 aa  366  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  43.34 
 
 
450 aa  367  1e-100  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  48.13 
 
 
380 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  42.79 
 
 
450 aa  354  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  44.16 
 
 
446 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  43.66 
 
 
433 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  44.21 
 
 
435 aa  352  8.999999999999999e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  44.21 
 
 
435 aa  352  8.999999999999999e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  43.68 
 
 
446 aa  351  1e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  44.44 
 
 
440 aa  347  3e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  43.43 
 
 
435 aa  346  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  43.23 
 
 
437 aa  344  1e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  43.65 
 
 
440 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  42.37 
 
 
440 aa  342  9e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  41.69 
 
 
449 aa  339  7e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  41.32 
 
 
445 aa  332  8e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  41.08 
 
 
445 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  41.44 
 
 
450 aa  319  6e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  40.91 
 
 
443 aa  312  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  44.22 
 
 
351 aa  296  5e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  32.47 
 
 
435 aa  216  5e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.95 
 
 
425 aa  200  3.9999999999999996e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  35.34 
 
 
461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  32.71 
 
 
426 aa  182  9.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  34.41 
 
 
414 aa  177  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.27 
 
 
454 aa  173  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  32.76 
 
 
480 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.12 
 
 
422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  31.61 
 
 
382 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  29.31 
 
 
427 aa  149  8e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  42.6 
 
 
176 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  63.06 
 
 
116 aa  144  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  31.91 
 
 
418 aa  137  5e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  27.54 
 
 
411 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  31.18 
 
 
435 aa  126  7e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  28.18 
 
 
422 aa  121  3e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.66 
 
 
416 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.14 
 
 
433 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.14 
 
 
433 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.14 
 
 
433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  27.93 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 
433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.3 
 
 
433 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 
434 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.79 
 
 
433 aa  113  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.49 
 
 
450 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  29.38 
 
 
460 aa  111  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  28.07 
 
 
423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  26.78 
 
 
450 aa  110  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  26.01 
 
 
433 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  31.54 
 
 
412 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  27.06 
 
 
362 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.62 
 
 
434 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.62 
 
 
434 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  28.78 
 
 
427 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  25.42 
 
 
430 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  25.59 
 
 
434 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  46.73 
 
 
222 aa  101  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.84 
 
 
430 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.28 
 
 
449 aa  100  6e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.91 
 
 
434 aa  100  6e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  28.82 
 
 
456 aa  100  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  28.91 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  27.19 
 
 
451 aa  94  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  25.98 
 
 
408 aa  93.6  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  28.74 
 
 
419 aa  89  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  27.93 
 
 
413 aa  89.4  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  23.58 
 
 
453 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  27.05 
 
 
451 aa  87.8  4e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>