193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_4153 on replicon NC_009430
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  100 
 
 		 450 aa  917    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  48.85 
 
 		 437 aa  375  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  47.33 
 
 		 433 aa  335  1e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  42.68 
 
 		 434 aa  326  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  47.54 
 
 		 435 aa  324  2e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  41.22 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  41.22 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  41.22 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  41.22 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  41.22 
 
 		 440 aa  320  3e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  41.44 
 
 		 435 aa  319  7e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  41.36 
 
 		 442 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  45.69 
 
 		 446 aa  317  3e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  40 
 
 		 439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  39.49 
 
 		 440 aa  310  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  40.34 
 
 		 439 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  43.5 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  43.5 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  42.16 
 
 		 444 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  39.49 
 
 		 438 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  39.77 
 
 		 435 aa  303  5.000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  40.99 
 
 		 440 aa  298  1e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  42.14 
 
 		 440 aa  295  1e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  40.94 
 
 		 441 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  43.81 
 
 		 447 aa  289  7e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  41.63 
 
 		 450 aa  289  7e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  38.14 
 
 		 439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  39.59 
 
 		 449 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  42.47 
 
 		 450 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  42.47 
 
 		 622 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  42.47 
 
 		 450 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  42.47 
 
 		 450 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  42.47 
 
 		 450 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  42.47 
 
 		 450 aa  283  6.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  45.9 
 
 		 444 aa  282  9e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  42.12 
 
 		 446 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  42.05 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  41.65 
 
 		 440 aa  278  2e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  44.9 
 
 		 446 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  40.89 
 
 		 445 aa  276  6e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  44.9 
 
 		 446 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  43.85 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  43.85 
 
 		 444 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  44.62 
 
 		 446 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  45.93 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  43.85 
 
 		 446 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  38.28 
 
 		 444 aa  270  4e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  39.69 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  39.33 
 
 		 446 aa  260  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  41.3 
 
 		 351 aa  259  8e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  38.57 
 
 		 441 aa  256  5e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  39.07 
 
 		 425 aa  231  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  33.68 
 
 		 435 aa  231  2e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  38.58 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  33.99 
 
 		 426 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  35.41 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  34.83 
 
 		 382 aa  169  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  35.76 
 
 		 422 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  32.49 
 
 		 433 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.84 
 
 		 454 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  31.42 
 
 		 435 aa  153  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  32.36 
 
 		 460 aa  149  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  34.17 
 
 		 480 aa  146  9e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  32.43 
 
 		 418 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  32.21 
 
 		 416 aa  141  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  33.92 
 
 		 422 aa  140  3e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 		 450 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  32.84 
 
 		 411 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  32.12 
 
 		 450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  31.34 
 
 		 430 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  32.06 
 
 		 449 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  32.37 
 
 		 434 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  32.04 
 
 		 453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  31.53 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  31.53 
 
 		 434 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  31.25 
 
 		 427 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  32.08 
 
 		 434 aa  126  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  30.62 
 
 		 430 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30.67 
 
 		 419 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.58 
 
 		 427 aa  116  8.999999999999998e-25  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  27.54 
 
 		 435 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25.96 
 
 		 423 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  32.37 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.37 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.44 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  29.17 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.85 
 
 		 433 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.85 
 
 		 433 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  35.8 
 
 		 176 aa  110  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  28.76 
 
 		 418 aa  109  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  29.41 
 
 		 412 aa  108  2e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.25 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.42 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.37 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  30.58 
 
 		 451 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  28.08 
 
 		 413 aa  99.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  31.1 
 
 		 437 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  31.1 
 
 		 437 aa  98.6  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  27.53 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  25.19 
 
 		 431 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>