156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1477 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 441 aa  911    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  68.95 
 
 		 439 aa  646    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  52.56 
 
 		 434 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  50.81 
 
 		 438 aa  442  1e-123  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  50.93 
 
 		 435 aa  441  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  52.18 
 
 		 439 aa  435  1e-121  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  50.23 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  50.45 
 
 		 444 aa  428  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  50.79 
 
 		 444 aa  424  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  48.98 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  49.42 
 
 		 435 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  50 
 
 		 444 aa  417  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  48.4 
 
 		 442 aa  412  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  49.08 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  48.85 
 
 		 622 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  49.32 
 
 		 446 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  48.53 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  49.08 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  49.08 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  49.08 
 
 		 450 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  49.2 
 
 		 446 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  48.53 
 
 		 444 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  49.2 
 
 		 446 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  48.42 
 
 		 450 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  47.03 
 
 		 440 aa  396  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  48.06 
 
 		 446 aa  398  1e-109  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  47.96 
 
 		 447 aa  395  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  48.28 
 
 		 440 aa  395  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  47.48 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  47.48 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  47.17 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  47.48 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  47.48 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  44.71 
 
 		 437 aa  383  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  47.48 
 
 		 440 aa  384  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  47.58 
 
 		 446 aa  380  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  45.07 
 
 		 450 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  47.69 
 
 		 440 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  47.4 
 
 		 445 aa  375  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  46.42 
 
 		 440 aa  374  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  46.28 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  46.28 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  45.45 
 
 		 435 aa  371  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  46.49 
 
 		 446 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  46.26 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  44.16 
 
 		 449 aa  360  3e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  47.96 
 
 		 380 aa  360  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  43.68 
 
 		 445 aa  348  9e-95  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  44.14 
 
 		 443 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  47.31 
 
 		 351 aa  300  2e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  40.94 
 
 		 450 aa  294  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  33.33 
 
 		 435 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.19 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  32.52 
 
 		 426 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  32.95 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.88 
 
 		 422 aa  178  2e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  31.96 
 
 		 480 aa  169  7e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  36.67 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  31.33 
 
 		 427 aa  154  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.19 
 
 		 454 aa  150  5e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  44.44 
 
 		 176 aa  146  8.000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  31.64 
 
 		 411 aa  137  4e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  30.48 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  31.63 
 
 		 449 aa  126  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  31.41 
 
 		 427 aa  126  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  49.14 
 
 		 222 aa  124  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.02 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  30.99 
 
 		 451 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  52.38 
 
 		 116 aa  117  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  32.15 
 
 		 418 aa  116  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  30.03 
 
 		 408 aa  109  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  28.74 
 
 		 422 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  29.63 
 
 		 450 aa  106  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  25.17 
 
 		 435 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  30.06 
 
 		 460 aa  105  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  31.27 
 
 		 433 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  28.8 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.45 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 		 433 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.35 
 
 		 433 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  29.44 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 433 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  28.96 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.65 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  26.9 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  28.96 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  27.97 
 
 		 453 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  30.1 
 
 		 412 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  29.56 
 
 		 440 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  29.02 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  28.03 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.07 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.07 
 
 		 434 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  28.27 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  29.57 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  27.16 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  26.52 
 
 		 413 aa  83.6  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  26.26 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>