231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1252 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  93.3 
 
 		 434 aa  827    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  100 
 
 		 434 aa  888    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  92.84 
 
 		 434 aa  823    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 434 aa  888    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  71.46 
 
 		 430 aa  633  1e-180  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  70.53 
 
 		 430 aa  623  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  43.86 
 
 		 460 aa  354  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  42.63 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  43.6 
 
 		 440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  33.82 
 
 		 416 aa  205  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  39.57 
 
 		 422 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  32.12 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  32.93 
 
 		 450 aa  178  2e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  36.09 
 
 		 414 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  33.67 
 
 		 453 aa  170  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  30.23 
 
 		 451 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  34.55 
 
 		 422 aa  151  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  32.95 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  32.95 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  32.95 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  32.95 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  32.95 
 
 		 440 aa  146  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  30.21 
 
 		 440 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  30.07 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  29.85 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  29.52 
 
 		 456 aa  134  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  29.58 
 
 		 433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  29.58 
 
 		 423 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.67 
 
 		 382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  31.56 
 
 		 435 aa  130  6e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  30.86 
 
 		 433 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  28.71 
 
 		 433 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  31.53 
 
 		 450 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  30.55 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  27.8 
 
 		 426 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  31.16 
 
 		 438 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  29.5 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  28.92 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  31.76 
 
 		 443 aa  125  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30.03 
 
 		 419 aa  123  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  30.56 
 
 		 418 aa  123  6e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  30.84 
 
 		 437 aa  120  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  27.27 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  29.97 
 
 		 439 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  29.25 
 
 		 435 aa  114  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.08 
 
 		 449 aa  113  7.000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  29.72 
 
 		 454 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  27.97 
 
 		 435 aa  110  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  30.72 
 
 		 480 aa  110  6e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  27.91 
 
 		 439 aa  110  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  29.65 
 
 		 446 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  26.54 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.92 
 
 		 425 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  33.45 
 
 		 404 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  37.23 
 
 		 412 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  26.8 
 
 		 444 aa  107  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2776  HipA domain protein  26.56 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2372  HipA domain protein  27.21 
 
 		 436 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  28.41 
 
 		 440 aa  106  9e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2508  hypothetical protein  25.97 
 
 		 445 aa  104  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.020002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  29.6 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  28.23 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  28.23 
 
 		 435 aa  103  5e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  28.38 
 
 		 445 aa  103  8e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  31.2 
 
 		 450 aa  103  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  27.62 
 
 		 435 aa  103  9e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  34.04 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.12 
 
 		 440 aa  101  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  28.29 
 
 		 446 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  30.51 
 
 		 351 aa  101  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  29.25 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  29.36 
 
 		 447 aa  99.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  28.71 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  28.06 
 
 		 446 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  28.44 
 
 		 433 aa  97.8  3e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  29.12 
 
 		 440 aa  97.4  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  28.8 
 
 		 427 aa  96.7  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  28.36 
 
 		 446 aa  95.9  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  28.86 
 
 		 437 aa  94.4  4e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  25.54 
 
 		 442 aa  93.2  8e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  26.47 
 
 		 418 aa  92.8  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  27.16 
 
 		 446 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  28.15 
 
 		 413 aa  91.7  2e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  27.33 
 
 		 445 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  27.16 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  27.76 
 
 		 444 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  27.16 
 
 		 444 aa  89.7  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  27.38 
 
 		 444 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  27.46 
 
 		 444 aa  87.8  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  28.12 
 
 		 461 aa  87.4  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  28.7 
 
 		 362 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  30.88 
 
 		 312 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  27.07 
 
 		 449 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  28.68 
 
 		 407 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  28.07 
 
 		 441 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  27.19 
 
 		 420 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.53 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  27.19 
 
 		 413 aa  83.2  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  29.07 
 
 		 427 aa  83.2  0.000000000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>