192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpl2292 on replicon NC_006369
Organism: Legionella pneumophila str. Lens



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  638    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  37.58 
 
 
312 aa  192  5e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  37.32 
 
 
318 aa  177  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  35.94 
 
 
318 aa  177  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  37.08 
 
 
317 aa  171  2e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  35.14 
 
 
305 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  37.31 
 
 
318 aa  149  5e-35  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  28.36 
 
 
527 aa  99  9e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.63 
 
 
422 aa  98.6  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  32.18 
 
 
404 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  30.19 
 
 
437 aa  97.8  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  33.07 
 
 
413 aa  97.8  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  32.84 
 
 
400 aa  96.7  4e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  29.09 
 
 
418 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  34.5 
 
 
413 aa  95.9  9e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  29.82 
 
 
617 aa  93.6  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  30.83 
 
 
413 aa  92.8  7e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  30.94 
 
 
430 aa  91.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  30.38 
 
 
403 aa  91.3  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  31.75 
 
 
430 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  28.7 
 
 
613 aa  89.7  6e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  31.2 
 
 
433 aa  89  9e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  28.31 
 
 
409 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  30.74 
 
 
395 aa  87  3e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  26.35 
 
 
414 aa  87.4  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  30.54 
 
 
402 aa  87.4  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 
420 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  29.68 
 
 
460 aa  86.7  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  29.29 
 
 
430 aa  86.7  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 
420 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  30.88 
 
 
434 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  30.88 
 
 
434 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  31.62 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  32.91 
 
 
420 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.94 
 
 
434 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  32.88 
 
 
420 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.94 
 
 
434 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.29 
 
 
408 aa  83.2  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  31.52 
 
 
620 aa  83.2  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  32.43 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  29.41 
 
 
425 aa  81.3  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  34.39 
 
 
251 aa  81.6  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  31.51 
 
 
454 aa  79.3  0.00000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  32.34 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  25.65 
 
 
418 aa  78.2  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  29.89 
 
 
524 aa  77.8  0.0000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  32.16 
 
 
435 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  31.61 
 
 
410 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  33.51 
 
 
443 aa  75.1  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  27.89 
 
 
448 aa  75.5  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  32.26 
 
 
418 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  28.02 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  34.55 
 
 
439 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  27.72 
 
 
432 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  31.58 
 
 
457 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  28.38 
 
 
381 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  28.88 
 
 
433 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  29.02 
 
 
427 aa  70.9  0.00000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  27.27 
 
 
416 aa  68.9  0.00000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  31.39 
 
 
396 aa  68.6  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  23.46 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  29.51 
 
 
422 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  28.18 
 
 
433 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  27.02 
 
 
435 aa  65.9  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.42 
 
 
435 aa  65.9  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  30.32 
 
 
439 aa  65.1  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  25.49 
 
 
417 aa  65.1  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  32.03 
 
 
420 aa  63.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  30.93 
 
 
453 aa  63.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  25.83 
 
 
526 aa  63.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  27.73 
 
 
434 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  28.91 
 
 
433 aa  62.8  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26 
 
 
433 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  26.84 
 
 
415 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  31.37 
 
 
419 aa  62.4  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  27.67 
 
 
434 aa  62  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  24.5 
 
 
419 aa  62  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  25.47 
 
 
409 aa  62  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  30.43 
 
 
435 aa  62  0.00000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  24.03 
 
 
447 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  31.13 
 
 
415 aa  60.8  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  26.32 
 
 
418 aa  60.8  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  24.38 
 
 
411 aa  60.5  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  25.73 
 
 
407 aa  59.3  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  26.47 
 
 
451 aa  59.3  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  27.65 
 
 
407 aa  59.3  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  25.2 
 
 
433 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  26.58 
 
 
429 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  24.78 
 
 
444 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  25.15 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.49 
 
 
432 aa  57.8  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  23.35 
 
 
449 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  29.37 
 
 
430 aa  58.2  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  28.12 
 
 
440 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  25 
 
 
423 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  26.11 
 
 
431 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  31.65 
 
 
387 aa  56.2  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  24.64 
 
 
451 aa  56.2  0.0000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  27.32 
 
 
440 aa  56.2  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>