177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4901 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  100 
 
 		 433 aa  877    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  66.44 
 
 		 437 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  66.44 
 
 		 437 aa  591  1e-167  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  36.43 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  34.19 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  36.52 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  35.19 
 
 		 437 aa  178  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  33.65 
 
 		 453 aa  172  9e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  32.04 
 
 		 404 aa  172  9e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  32.29 
 
 		 400 aa  167  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  33.08 
 
 		 413 aa  167  2e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  35.92 
 
 		 447 aa  162  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  33.17 
 
 		 413 aa  162  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  31.03 
 
 		 418 aa  157  3e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  30.42 
 
 		 420 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  30.42 
 
 		 420 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  30.19 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  30.19 
 
 		 420 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  30.19 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  34.47 
 
 		 430 aa  144  4e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  29.27 
 
 		 418 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  33.01 
 
 		 413 aa  133  5e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  31.54 
 
 		 415 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28.68 
 
 		 422 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  29.82 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  27.42 
 
 		 447 aa  90.9  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  30.63 
 
 		 408 aa  89.7  8e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  31 
 
 		 409 aa  89.7  9e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  30.94 
 
 		 450 aa  87.4  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  31.32 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  31.32 
 
 		 435 aa  86.7  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  29.71 
 
 		 446 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.19 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  27.65 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  29.41 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  30.67 
 
 		 396 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  32.55 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.03 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  26.94 
 
 		 435 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.03 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  26.82 
 
 		 446 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  26.48 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  27.6 
 
 		 433 aa  79.3  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  27.04 
 
 		 442 aa  79  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.12 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  29.39 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  26.99 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  28.52 
 
 		 446 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.87 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.6 
 
 		 434 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  25.94 
 
 		 444 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25.35 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  29.9 
 
 		 440 aa  74.7  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  27.33 
 
 		 449 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  29.27 
 
 		 426 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  31.18 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  26.21 
 
 		 435 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  26.01 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  26.69 
 
 		 395 aa  74.3  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.26 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  26.94 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25.35 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  28.23 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  27.8 
 
 		 439 aa  73.9  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  25.94 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  28.32 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  26.37 
 
 		 445 aa  73.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  25.95 
 
 		 425 aa  72.8  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  25.92 
 
 		 446 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  27.59 
 
 		 449 aa  72.4  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  25.07 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  28.28 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  27.03 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  27.03 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  27.03 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  27.03 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  27.03 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  24.09 
 
 		 441 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  25.26 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28.88 
 
 		 312 aa  70.5  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  29.08 
 
 		 454 aa  70.9  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  27.88 
 
 		 380 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  25.65 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.67 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  31.36 
 
 		 437 aa  69.3  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  25.62 
 
 		 362 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  27.24 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  28.62 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  28.65 
 
 		 451 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.49 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  26.51 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  25.78 
 
 		 446 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  27.96 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  25.5 
 
 		 460 aa  67.4  0.0000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.24 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  25.78 
 
 		 446 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  28.87 
 
 		 418 aa  66.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  25.68 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  28.9 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>