167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2046 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  100 
 
 		 251 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  60.42 
 
 		 425 aa  313  1.9999999999999998e-84  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  49.79 
 
 		 381 aa  244  8e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  49.57 
 
 		 402 aa  235  6e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  49.36 
 
 		 403 aa  230  1e-59  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  38.94 
 
 		 395 aa  176  2e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  38.67 
 
 		 410 aa  156  3e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  35.68 
 
 		 439 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  36.67 
 
 		 457 aa  145  4.0000000000000006e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  29.17 
 
 		 449 aa  114  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  30.71 
 
 		 449 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  33.47 
 
 		 413 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  34.17 
 
 		 413 aa  106  3e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  30.99 
 
 		 418 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  27.92 
 
 		 444 aa  103  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  37.2 
 
 		 413 aa  95.5  7e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  29.74 
 
 		 617 aa  92.8  4e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  30.4 
 
 		 404 aa  90.1  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  32.24 
 
 		 408 aa  89.7  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  32.12 
 
 		 418 aa  87.8  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  28.88 
 
 		 400 aa  87.4  2e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  37.04 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  34.07 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  32.78 
 
 		 613 aa  82.8  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  34.39 
 
 		 312 aa  81.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.77 
 
 		 433 aa  80.1  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  31.52 
 
 		 620 aa  77  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  38.1 
 
 		 317 aa  75.5  0.0000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  34 
 
 		 305 aa  75.1  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.13 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  29.6 
 
 		 437 aa  72.8  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  39.34 
 
 		 318 aa  72  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  39.67 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.63 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  31.22 
 
 		 409 aa  70.5  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  31.68 
 
 		 420 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  31.49 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  31.68 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  31.68 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  35.21 
 
 		 434 aa  69.3  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  31.06 
 
 		 420 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  31.06 
 
 		 420 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  35.21 
 
 		 434 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  35.21 
 
 		 434 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  35.21 
 
 		 434 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  29.86 
 
 		 448 aa  65.9  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  27.49 
 
 		 409 aa  66.2  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  33.33 
 
 		 527 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  31.03 
 
 		 318 aa  64.7  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  32.47 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  28.91 
 
 		 422 aa  63.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  31.19 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  30.85 
 
 		 460 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  29.7 
 
 		 435 aa  62.8  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  32.28 
 
 		 440 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  26.55 
 
 		 431 aa  62.4  0.000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  29.52 
 
 		 439 aa  62.4  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  31.61 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  31.21 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  34.5 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.19 
 
 		 422 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  37.14 
 
 		 453 aa  59.3  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  33.33 
 
 		 435 aa  59.3  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  28.14 
 
 		 415 aa  58.9  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  29.53 
 
 		 426 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  29.48 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  29.49 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  28.42 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  29.84 
 
 		 446 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  30.49 
 
 		 416 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  31.43 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  28.8 
 
 		 431 aa  57.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.2 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.86 
 
 		 454 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  28.57 
 
 		 418 aa  57  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  26.58 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  28.89 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  31.25 
 
 		 438 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  33.06 
 
 		 443 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  27.52 
 
 		 417 aa  54.7  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  30.38 
 
 		 437 aa  55.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  30.38 
 
 		 437 aa  54.7  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  28.39 
 
 		 427 aa  55.1  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  27.07 
 
 		 433 aa  54.3  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  30.3 
 
 		 440 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  30.3 
 
 		 440 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  30.3 
 
 		 440 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  26.37 
 
 		 407 aa  53.5  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  30.3 
 
 		 440 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  26.9 
 
 		 440 aa  53.5  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  30.3 
 
 		 440 aa  53.5  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 420 aa  53.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  26.2 
 
 		 435 aa  52.8  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  31.21 
 
 		 425 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  26.47 
 
 		 414 aa  52.8  0.000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  26.37 
 
 		 415 aa  52.8  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  24.31 
 
 		 425 aa  52.4  0.000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  25.12 
 
 		 440 aa  52.4  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  30.3 
 
 		 351 aa  52  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>