126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0672 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 457 aa  953    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  38.68 
 
 		 410 aa  252  1e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  39.42 
 
 		 381 aa  220  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  40.32 
 
 		 402 aa  215  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  39.5 
 
 		 403 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  35.94 
 
 		 425 aa  202  9.999999999999999e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  32.71 
 
 		 439 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  27.45 
 
 		 395 aa  153  7e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  36.67 
 
 		 251 aa  145  1e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  30.86 
 
 		 449 aa  120  3.9999999999999996e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  30.19 
 
 		 449 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  30.69 
 
 		 444 aa  109  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  26.68 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  24.7 
 
 		 418 aa  87  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  25.7 
 
 		 420 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  24.22 
 
 		 420 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  25.96 
 
 		 420 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  25.7 
 
 		 420 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  25.51 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  27.92 
 
 		 413 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  30.06 
 
 		 437 aa  83.2  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  26.44 
 
 		 413 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  25.26 
 
 		 430 aa  76.6  0.0000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  28.16 
 
 		 437 aa  75.9  0.000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  24.51 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  30.98 
 
 		 312 aa  74.3  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  28.28 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  29.76 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  23.91 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.89 
 
 		 408 aa  71.2  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  25.38 
 
 		 382 aa  71.2  0.00000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  28.14 
 
 		 305 aa  70.1  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.07 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  29.69 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.07 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  23.24 
 
 		 439 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  24.6 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  29.69 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  26.69 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  27.92 
 
 		 443 aa  68.2  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  26.69 
 
 		 437 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  23.33 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  25.16 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  25.16 
 
 		 419 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  26.02 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  26.02 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  26.02 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  26.02 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  26.02 
 
 		 440 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  25.81 
 
 		 460 aa  66.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  22.99 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  23.25 
 
 		 404 aa  63.5  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  28.57 
 
 		 448 aa  63.5  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  28.03 
 
 		 415 aa  63.2  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  28.16 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  26.24 
 
 		 414 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  26.05 
 
 		 435 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  29.37 
 
 		 440 aa  62  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  25.08 
 
 		 419 aa  62  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.83 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  26.11 
 
 		 430 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  23.73 
 
 		 431 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  30.23 
 
 		 318 aa  60.8  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.96 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  30.23 
 
 		 318 aa  60.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  25.63 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  25.83 
 
 		 443 aa  60.1  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  29.81 
 
 		 317 aa  60.1  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  24.24 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  24.46 
 
 		 419 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  22.12 
 
 		 435 aa  56.2  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  24.47 
 
 		 422 aa  55.8  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  28.44 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  26.6 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  23.94 
 
 		 409 aa  55.8  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  27.18 
 
 		 447 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  27.69 
 
 		 453 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  23.96 
 
 		 433 aa  53.9  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  23.01 
 
 		 434 aa  53.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  26.27 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  23.39 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  24.65 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  23.71 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  28.7 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  25.93 
 
 		 318 aa  51.6  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  24.21 
 
 		 431 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.01 
 
 		 435 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  25.31 
 
 		 450 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  22.92 
 
 		 454 aa  51.2  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  24.51 
 
 		 445 aa  50.8  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  26.06 
 
 		 449 aa  50.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  23.49 
 
 		 362 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  24 
 
 		 442 aa  50.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  27.15 
 
 		 444 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.74 
 
 		 419 aa  48.9  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  24.13 
 
 		 453 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.99 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  24.83 
 
 		 351 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  26.24 
 
 		 412 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  22.74 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>