129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3103 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  70.18 
 
 		 449 aa  651    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 449 aa  924    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  71.75 
 
 		 444 aa  657    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  34.66 
 
 		 439 aa  229  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  34.05 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  33.07 
 
 		 403 aa  187  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  30.4 
 
 		 425 aa  176  9e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  30.73 
 
 		 381 aa  171  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  26.99 
 
 		 395 aa  133  7.999999999999999e-30  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  31.85 
 
 		 410 aa  131  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  30.86 
 
 		 457 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  29.17 
 
 		 251 aa  114  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  30.13 
 
 		 408 aa  97.1  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  26.81 
 
 		 409 aa  84.7  0.000000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  27.79 
 
 		 422 aa  80.5  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  27 
 
 		 418 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  26.42 
 
 		 431 aa  72.4  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  26.86 
 
 		 430 aa  68.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  34.11 
 
 		 620 aa  66.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  28.31 
 
 		 419 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  27.46 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  27.19 
 
 		 461 aa  64.7  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  26.38 
 
 		 430 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  25.96 
 
 		 443 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  32.82 
 
 		 613 aa  63.2  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  27.74 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  27.86 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  27.08 
 
 		 414 aa  62.8  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.08 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  24.91 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  25.57 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  27.37 
 
 		 413 aa  61.2  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  32.33 
 
 		 617 aa  60.8  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  25.77 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.77 
 
 		 433 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.87 
 
 		 430 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.37 
 
 		 434 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25.46 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  24.77 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  24.77 
 
 		 433 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  24.77 
 
 		 423 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  24.33 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.63 
 
 		 418 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  29.26 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  29.26 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.37 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  24.55 
 
 		 438 aa  58.2  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  26.26 
 
 		 453 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.52 
 
 		 433 aa  57.4  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.97 
 
 		 434 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.97 
 
 		 434 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  28.26 
 
 		 396 aa  56.6  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  25.78 
 
 		 440 aa  56.6  0.0000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  25.28 
 
 		 433 aa  56.6  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  29.32 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  28.32 
 
 		 527 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  25.14 
 
 		 450 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  24.68 
 
 		 427 aa  56.2  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  24.36 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.31 
 
 		 435 aa  55.8  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  31.11 
 
 		 446 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  22.54 
 
 		 312 aa  55.1  0.000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  26.21 
 
 		 416 aa  54.7  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  24.48 
 
 		 433 aa  54.7  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  26.45 
 
 		 413 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  26.43 
 
 		 404 aa  54.3  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  24.48 
 
 		 441 aa  54.3  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  27.62 
 
 		 441 aa  53.5  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  22.42 
 
 		 526 aa  53.1  0.000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  26.73 
 
 		 318 aa  53.1  0.000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  28.57 
 
 		 312 aa  52.8  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  27.08 
 
 		 440 aa  52.8  0.00001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  27.65 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  23.03 
 
 		 524 aa  52  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  23.41 
 
 		 439 aa  52  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  25.23 
 
 		 440 aa  51.6  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  28.57 
 
 		 444 aa  51.2  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  27.36 
 
 		 445 aa  51.2  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  24.67 
 
 		 413 aa  50.8  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  22.26 
 
 		 418 aa  50.8  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  26.97 
 
 		 450 aa  50.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  24.56 
 
 		 400 aa  50.1  0.00008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  24.79 
 
 		 418 aa  50.1  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  26.8 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  28.24 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  27.08 
 
 		 318 aa  49.3  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  26.74 
 
 		 454 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  26.74 
 
 		 449 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.22 
 
 		 425 aa  48.5  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  22.44 
 
 		 435 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  24.71 
 
 		 434 aa  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  27.12 
 
 		 351 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  28.06 
 
 		 317 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  27.92 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  31.37 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  22.13 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  26.55 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  26.55 
 
 		 440 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>