141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_0205 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  787    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  46.04 
 
 		 425 aa  346  4e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  44.15 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  41.69 
 
 		 403 aa  266  5e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  49.79 
 
 		 251 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  35.54 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  37.87 
 
 		 457 aa  217  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  34.21 
 
 		 439 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  34.66 
 
 		 410 aa  176  6e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  30.73 
 
 		 449 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  29.77 
 
 		 444 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  29.41 
 
 		 449 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  30.72 
 
 		 418 aa  99.4  9e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 		 413 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  28.66 
 
 		 413 aa  88.2  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  30.98 
 
 		 432 aa  88.6  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  31.92 
 
 		 408 aa  87.8  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  28.96 
 
 		 413 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  31.08 
 
 		 617 aa  83.2  0.000000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.57 
 
 		 418 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  28.99 
 
 		 448 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  29.91 
 
 		 305 aa  77.4  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  30.43 
 
 		 613 aa  75.1  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  33.67 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  26.71 
 
 		 420 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  27.46 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  31.44 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  27.24 
 
 		 382 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  26.71 
 
 		 420 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  27.64 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  29.69 
 
 		 422 aa  71.6  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.67 
 
 		 414 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30.19 
 
 		 419 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.03 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28.38 
 
 		 312 aa  71.2  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  26.71 
 
 		 420 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  32.2 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  26.87 
 
 		 420 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  26.71 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  29.29 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  31.03 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  29.29 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  28.71 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  28.71 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  28.39 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  28.71 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  28.71 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  28.71 
 
 		 440 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  25.94 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  27.93 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  32.69 
 
 		 427 aa  67  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  26.87 
 
 		 430 aa  67  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  27.65 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  25.5 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  24.91 
 
 		 318 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  29.18 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  29.18 
 
 		 434 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.39 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  29 
 
 		 312 aa  62.8  0.00000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  26.92 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.69 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  27.52 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  26.78 
 
 		 416 aa  58.9  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  26.69 
 
 		 423 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  25.26 
 
 		 435 aa  59.3  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  33.54 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  26.04 
 
 		 454 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  28.52 
 
 		 437 aa  58.2  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  28.98 
 
 		 443 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  30.33 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  25.35 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  31.45 
 
 		 440 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  26.79 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  27.2 
 
 		 439 aa  57.4  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  24.11 
 
 		 440 aa  57  0.0000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 		 437 aa  56.6  0.0000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20530  hypothetical protein  46.43 
 
 		 84 aa  56.2  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  25.55 
 
 		 435 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  25.89 
 
 		 437 aa  55.8  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  30.54 
 
 		 429 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  24.75 
 
 		 453 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  26.74 
 
 		 412 aa  54.7  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  26.36 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.46 
 
 		 430 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  25.94 
 
 		 431 aa  53.9  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  27.33 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  27.33 
 
 		 435 aa  54.3  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  26.97 
 
 		 412 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  26.28 
 
 		 446 aa  53.9  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  26.05 
 
 		 409 aa  53.9  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  25.24 
 
 		 419 aa  53.5  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  23.35 
 
 		 433 aa  53.1  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  27.05 
 
 		 418 aa  53.1  0.000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  24.53 
 
 		 524 aa  52.8  0.00001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  29.15 
 
 		 418 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  28.07 
 
 		 445 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.92 
 
 		 433 aa  51.6  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  26.6 
 
 		 450 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  23.4 
 
 		 440 aa  51.6  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  30.41 
 
 		 449 aa  51.6  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>