159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3446 on replicon NC_009468
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  62.23 
 
 		 613 aa  759    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 617 aa  1236    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  69.4 
 
 		 620 aa  759    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  29.8 
 
 		 318 aa  98.6  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  28.34 
 
 		 414 aa  96.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  29.82 
 
 		 312 aa  94  7e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  29.74 
 
 		 251 aa  93.2  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  31.82 
 
 		 305 aa  93.2  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  27.05 
 
 		 425 aa  91.7  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  31.34 
 
 		 317 aa  90.9  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  35.22 
 
 		 318 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  35.14 
 
 		 318 aa  86.7  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  32.28 
 
 		 312 aa  86.3  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  27.72 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  31.08 
 
 		 381 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  31.15 
 
 		 437 aa  82  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  36.84 
 
 		 396 aa  81.3  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  31.91 
 
 		 445 aa  80.5  0.00000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  36.25 
 
 		 409 aa  79.7  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  26.01 
 
 		 395 aa  79.7  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.47 
 
 		 433 aa  78.6  0.0000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.77 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  29.89 
 
 		 440 aa  78.2  0.0000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  31.61 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30.93 
 
 		 419 aa  77.4  0.0000000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  30.48 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  29.87 
 
 		 446 aa  76.6  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  32.28 
 
 		 430 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  29.89 
 
 		 402 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  27.64 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  30.31 
 
 		 441 aa  76.3  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  31.14 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  31.14 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  31.14 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  31.14 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  28.53 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  31.14 
 
 		 440 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  33.51 
 
 		 440 aa  75.1  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  31.14 
 
 		 351 aa  74.7  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  30.5 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  27.56 
 
 		 439 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  31.71 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  29.09 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  32.34 
 
 		 434 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  29.14 
 
 		 449 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  30.69 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  30.69 
 
 		 434 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  28.3 
 
 		 418 aa  73.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  27.82 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  29.2 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  32.34 
 
 		 434 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  26.97 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  29.38 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  30.52 
 
 		 439 aa  72  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  30.73 
 
 		 435 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  27.23 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  28.88 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.1 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  33.12 
 
 		 418 aa  69.3  0.0000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  32.64 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  32.81 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  27.86 
 
 		 444 aa  68.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  32.8 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  29.91 
 
 		 400 aa  68.2  0.0000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  30.5 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  28.83 
 
 		 444 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  33.84 
 
 		 443 aa  67  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  32.75 
 
 		 440 aa  66.6  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  26.8 
 
 		 439 aa  66.6  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  27.38 
 
 		 418 aa  67  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4032  HipA domain-containing protein  31.18 
 
 		 444 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.716492 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  28.8 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 418 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  30.99 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  29.86 
 
 		 427 aa  65.5  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  25.22 
 
 		 524 aa  65.1  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  32.93 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  32.24 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  32 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  30.32 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  30.42 
 
 		 446 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  31.1 
 
 		 416 aa  63.5  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  28.57 
 
 		 449 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  28.44 
 
 		 451 aa  63.2  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  28.93 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  28.57 
 
 		 622 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  31.77 
 
 		 444 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  28.93 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  28.93 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  28.93 
 
 		 450 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  26.79 
 
 		 447 aa  62  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  31.6 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  30.72 
 
 		 422 aa  62  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  26.49 
 
 		 442 aa  62  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  21.1 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  28.93 
 
 		 450 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  25.96 
 
 		 404 aa  61.2  0.00000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  27.74 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  28.94 
 
 		 413 aa  60.8  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  29.09 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>