140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4056 on replicon NC_007959
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  100 
 
 		 613 aa  1237    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  62.23 
 
 		 617 aa  749    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0556  HipA domain-containing protein  77.32 
 
 		 620 aa  939    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0889579  normal  0.841401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  31.94 
 
 		 414 aa  105  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  30.92 
 
 		 318 aa  97.8  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  32.56 
 
 		 317 aa  94.4  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  33.18 
 
 		 318 aa  92.8  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  29.63 
 
 		 305 aa  91.3  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  32.72 
 
 		 318 aa  90.9  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  31.15 
 
 		 312 aa  90.1  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28.7 
 
 		 312 aa  89.7  1e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  31.02 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  35.24 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  28.12 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  31 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  27.97 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  31.56 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  27.02 
 
 		 400 aa  79  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  29.19 
 
 		 447 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  34.09 
 
 		 396 aa  78.2  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  26.7 
 
 		 419 aa  77.8  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.7 
 
 		 408 aa  78.2  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  29.78 
 
 		 446 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  30.43 
 
 		 381 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  31.94 
 
 		 433 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  29 
 
 		 439 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  28.92 
 
 		 413 aa  72.8  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  29.43 
 
 		 446 aa  71.6  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30.41 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  24.51 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  29.41 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  35.33 
 
 		 409 aa  68.6  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  29.2 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  30.53 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  32.26 
 
 		 440 aa  67  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  28.79 
 
 		 437 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  32.52 
 
 		 418 aa  67  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  29.27 
 
 		 418 aa  66.6  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  29.18 
 
 		 446 aa  67  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  30.77 
 
 		 622 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  27.61 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 		 441 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  29.82 
 
 		 445 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  28.24 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  33.53 
 
 		 427 aa  65.1  0.000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  27.31 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  30.89 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.77 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  30.89 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  29.03 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  30.89 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  30.89 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  30.89 
 
 		 450 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0939  HipA-like-like  22.22 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.578298  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  32 
 
 		 446 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  26.55 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  24.41 
 
 		 440 aa  64.3  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  30.26 
 
 		 438 aa  63.9  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 		 446 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  29.72 
 
 		 413 aa  63.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3103  HipA domain-containing protein  32.82 
 
 		 449 aa  63.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.891938  normal  0.0171955 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  30.39 
 
 		 440 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  29.86 
 
 		 446 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  27.14 
 
 		 442 aa  62.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  29.81 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  30.29 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  29.41 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  25.58 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  27.81 
 
 		 410 aa  62.4  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  29.86 
 
 		 446 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  27.16 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  27.65 
 
 		 380 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  27.2 
 
 		 444 aa  60.8  0.00000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  30.06 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  30.35 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  30.35 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  30.35 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  30.35 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  30.35 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  31.5 
 
 		 411 aa  60.1  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 444 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  31.43 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  29.35 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  26.17 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 444 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0482  hypothetical protein  27.06 
 
 		 524 aa  59.7  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.113646  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  32.12 
 
 		 420 aa  58.9  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  31.4 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  28.57 
 
 		 430 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  28.38 
 
 		 449 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  27.44 
 
 		 450 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  24.15 
 
 		 439 aa  58.9  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  28.79 
 
 		 415 aa  58.5  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 444 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.95 
 
 		 416 aa  57.8  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1930  hypothetical protein  32.06 
 
 		 449 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  27.97 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>