230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6255 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  100 
 
 
434 aa  882    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  93.3 
 
 
434 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  72.33 
 
 
430 aa  635    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  98.62 
 
 
434 aa  871    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  93.3 
 
 
434 aa  827    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  71.4 
 
 
430 aa  624  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  44.39 
 
 
460 aa  355  1e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  43.55 
 
 
433 aa  317  2e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  44.39 
 
 
440 aa  308  9e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  38.7 
 
 
416 aa  202  8e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  39.57 
 
 
422 aa  199  7e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  32.69 
 
 
450 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  36.09 
 
 
414 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  31.95 
 
 
450 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  32.5 
 
 
453 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  33.24 
 
 
451 aa  163  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  33.09 
 
 
422 aa  144  3e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  31.47 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  31.47 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  31.47 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  31.47 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  31.47 
 
 
440 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.87 
 
 
382 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  30.46 
 
 
456 aa  129  8.000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  32.37 
 
 
450 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  29.33 
 
 
440 aa  127  3e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  28.5 
 
 
433 aa  126  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  28.27 
 
 
426 aa  126  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  31.56 
 
 
438 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  28.39 
 
 
431 aa  125  1e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  28.46 
 
 
433 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  29.01 
 
 
423 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  31.27 
 
 
435 aa  125  2e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  29.97 
 
 
433 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  29.68 
 
 
418 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  30.47 
 
 
433 aa  123  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  29.39 
 
 
433 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  30.84 
 
 
437 aa  121  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  29.68 
 
 
433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  27.93 
 
 
435 aa  120  3e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  31.97 
 
 
443 aa  120  6e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30.3 
 
 
419 aa  119  7e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  27.76 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.67 
 
 
434 aa  117  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  29.79 
 
 
439 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2776  HipA domain protein  26.56 
 
 
436 aa  113  6e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  29.69 
 
 
435 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2372  HipA domain protein  27.44 
 
 
436 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  28.85 
 
 
435 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  31.55 
 
 
404 aa  111  3e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30 
 
 
449 aa  109  8.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  29.22 
 
 
480 aa  108  2e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  31.99 
 
 
400 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  28.12 
 
 
439 aa  108  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  36.5 
 
 
412 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.65 
 
 
425 aa  107  5e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2508  hypothetical protein  24.83 
 
 
445 aa  106  7e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.020002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  28.88 
 
 
418 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  28.4 
 
 
435 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  28.4 
 
 
435 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  29.07 
 
 
446 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  28.41 
 
 
434 aa  103  5e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28.57 
 
 
454 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.59 
 
 
435 aa  101  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  26.29 
 
 
444 aa  101  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  29.67 
 
 
427 aa  100  4e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  27.17 
 
 
440 aa  99.8  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  29.55 
 
 
439 aa  99.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  30.53 
 
 
362 aa  97.4  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  29.79 
 
 
437 aa  97.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  29.66 
 
 
447 aa  97.1  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  30.08 
 
 
351 aa  96.7  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.35 
 
 
418 aa  95.9  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  28.12 
 
 
446 aa  95.1  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  26.85 
 
 
413 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  28.14 
 
 
433 aa  95.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  27.25 
 
 
440 aa  95.5  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  27.99 
 
 
440 aa  94.4  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  27.83 
 
 
445 aa  94.4  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  28.32 
 
 
430 aa  92.8  9e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  28.9 
 
 
450 aa  91.3  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  26.69 
 
 
445 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  28.38 
 
 
446 aa  90.9  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  27.65 
 
 
446 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  28.28 
 
 
413 aa  88.6  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  26.47 
 
 
442 aa  87  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  28.42 
 
 
420 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  27.16 
 
 
446 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  29.38 
 
 
461 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  30.7 
 
 
402 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  27.94 
 
 
312 aa  84.7  0.000000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  30.91 
 
 
403 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  28.16 
 
 
407 aa  84  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  24.69 
 
 
407 aa  84  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 
420 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  28.53 
 
 
427 aa  83.2  0.000000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 
420 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 
420 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  26.67 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>