146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4225 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  88.28 
 
 
446 aa  773    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  84.68 
 
 
446 aa  752    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  88.26 
 
 
444 aa  782    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  84.91 
 
 
446 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  100 
 
 
444 aa  902    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  86.07 
 
 
446 aa  761    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  88.26 
 
 
444 aa  801    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  70 
 
 
444 aa  634  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  67.95 
 
 
450 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  68.03 
 
 
622 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  67.95 
 
 
450 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  67.95 
 
 
450 aa  599  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  67.95 
 
 
450 aa  598  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  67.95 
 
 
450 aa  599  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  59.4 
 
 
442 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  66.58 
 
 
380 aa  527  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  59.22 
 
 
444 aa  524  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  54.76 
 
 
450 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  54.17 
 
 
440 aa  445  1.0000000000000001e-124  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  52.37 
 
 
446 aa  436  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  50.68 
 
 
441 aa  430  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  50.45 
 
 
441 aa  428  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  52.08 
 
 
447 aa  431  1e-119  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  50.57 
 
 
446 aa  431  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  52.17 
 
 
445 aa  419  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  52.35 
 
 
446 aa  421  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  49.06 
 
 
439 aa  411  1e-113  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  47.06 
 
 
449 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  46.92 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  48.27 
 
 
440 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  48.85 
 
 
445 aa  401  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  50.58 
 
 
440 aa  397  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  45.75 
 
 
438 aa  385  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  46.07 
 
 
434 aa  381  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  44.52 
 
 
439 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  48.63 
 
 
435 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  48.63 
 
 
435 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  45.52 
 
 
435 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  42.89 
 
 
439 aa  358  8e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  41.8 
 
 
440 aa  330  4e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  44.14 
 
 
435 aa  330  4e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  43.59 
 
 
437 aa  327  3e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  41.97 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  41.97 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  41.97 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  41.97 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  41.97 
 
 
440 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  41.19 
 
 
433 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  44.52 
 
 
443 aa  290  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  45.9 
 
 
450 aa  282  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  41.96 
 
 
351 aa  256  7e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  31.08 
 
 
435 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  35.57 
 
 
426 aa  191  2e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  33.25 
 
 
425 aa  176  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  36.21 
 
 
480 aa  167  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  33.41 
 
 
461 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.2 
 
 
422 aa  157  3e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  33.67 
 
 
411 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  33.16 
 
 
454 aa  153  5e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.54 
 
 
414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  30.41 
 
 
427 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  31.16 
 
 
418 aa  134  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.72 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.87 
 
 
382 aa  125  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  29.36 
 
 
435 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  37.97 
 
 
176 aa  117  5e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  31.75 
 
 
422 aa  114  4.0000000000000004e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.58 
 
 
433 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.71 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  28.49 
 
 
450 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.95 
 
 
433 aa  107  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.34 
 
 
433 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  46.22 
 
 
222 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  28.96 
 
 
362 aa  103  8e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  30.36 
 
 
416 aa  101  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  28.29 
 
 
450 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  30.68 
 
 
427 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.09 
 
 
433 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  26.38 
 
 
423 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  26.14 
 
 
433 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  46.55 
 
 
116 aa  98.2  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.73 
 
 
433 aa  96.3  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  28.16 
 
 
437 aa  92  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.16 
 
 
434 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.16 
 
 
434 aa  89.7  8e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  27.89 
 
 
437 aa  89.4  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 
435 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  30 
 
 
451 aa  88.2  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.45 
 
 
433 aa  87.8  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  27.58 
 
 
451 aa  87  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.23 
 
 
419 aa  87  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  24.92 
 
 
434 aa  86.3  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.46 
 
 
430 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  27.25 
 
 
453 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
440 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  27.71 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  25.51 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  26.07 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  24.83 
 
 
430 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  29.05 
 
 
418 aa  77.8  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>