172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0687 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  100 
 
 		 413 aa  833    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  64.69 
 
 		 413 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  63.83 
 
 		 418 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  65.76 
 
 		 413 aa  527  1e-148  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  38.24 
 
 		 400 aa  243  7e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  35.54 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  35.95 
 
 		 418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  37.28 
 
 		 437 aa  217  2.9999999999999998e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  32.91 
 
 		 420 aa  181  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  33 
 
 		 420 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  32.75 
 
 		 420 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  32.75 
 
 		 420 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  32.24 
 
 		 420 aa  177  3e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  34.45 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  33.26 
 
 		 432 aa  149  1.0000000000000001e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  31.71 
 
 		 415 aa  145  1e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  34.81 
 
 		 447 aa  144  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  31.41 
 
 		 448 aa  143  6e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  31.78 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.67 
 
 		 422 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  30.99 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  30.99 
 
 		 437 aa  120  6e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  29.14 
 
 		 453 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  29.59 
 
 		 443 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  32.21 
 
 		 403 aa  100  4e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  26.39 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  34.91 
 
 		 251 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  34.5 
 
 		 312 aa  95.9  1e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  32.34 
 
 		 409 aa  92.8  9e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  29.59 
 
 		 402 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  31.5 
 
 		 418 aa  89.7  8e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  28.44 
 
 		 461 aa  87.8  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  29.65 
 
 		 414 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  28.68 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  28.05 
 
 		 435 aa  87  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  29.94 
 
 		 435 aa  87  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  27.7 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.37 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  28.96 
 
 		 381 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.37 
 
 		 460 aa  84.7  0.000000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  29.73 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  30.07 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  28.15 
 
 		 426 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  28.34 
 
 		 422 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.82 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  27.67 
 
 		 433 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  27.67 
 
 		 423 aa  82  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  26.58 
 
 		 427 aa  82  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  27.92 
 
 		 457 aa  80.9  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  26.15 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  26.98 
 
 		 425 aa  79.7  0.00000000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  29.7 
 
 		 396 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  25.61 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  25.61 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  25.61 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  25.61 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  25.61 
 
 		 440 aa  78.6  0.0000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  29.89 
 
 		 447 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  33.49 
 
 		 317 aa  77.8  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  27.45 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  27.35 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  27.38 
 
 		 382 aa  77.8  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  32.7 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  32.85 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  28.92 
 
 		 450 aa  76.3  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  27.59 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.47 
 
 		 430 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  31.76 
 
 		 312 aa  75.5  0.000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  32.08 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  26.41 
 
 		 444 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  24.76 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  28.09 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.35 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.35 
 
 		 434 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.18 
 
 		 440 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.86 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  28.02 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  28.79 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  28.37 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  23.56 
 
 		 395 aa  70.5  0.00000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  26.47 
 
 		 480 aa  70.5  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  26.96 
 
 		 434 aa  70.1  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  29.68 
 
 		 318 aa  69.7  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.27 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  25.43 
 
 		 442 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  26.61 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.27 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.57 
 
 		 435 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.19 
 
 		 449 aa  68.6  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  28.45 
 
 		 362 aa  68.2  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  25.89 
 
 		 380 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  27.42 
 
 		 440 aa  67.4  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  24.88 
 
 		 439 aa  67  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.67 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  28.7 
 
 		 440 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  28 
 
 		 439 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.72 
 
 		 427 aa  65.9  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  24.88 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  24.94 
 
 		 439 aa  65.5  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>