176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_1621 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 		 437 aa  886    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  99.08 
 
 		 437 aa  879    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  66.44 
 
 		 433 aa  592  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  34.78 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  34.52 
 
 		 432 aa  194  2e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  33.16 
 
 		 448 aa  170  4e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  32.86 
 
 		 437 aa  167  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  35.08 
 
 		 453 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  32.26 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  32.84 
 
 		 430 aa  159  8e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  32.56 
 
 		 413 aa  152  1e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  31.87 
 
 		 447 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  31.16 
 
 		 420 aa  147  5e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  30.92 
 
 		 420 aa  145  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  31.89 
 
 		 413 aa  145  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  30.68 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  30.43 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  30.92 
 
 		 420 aa  144  4e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  30 
 
 		 404 aa  143  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  30.62 
 
 		 400 aa  141  3e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  30.42 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  28.95 
 
 		 415 aa  124  5e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  30.99 
 
 		 413 aa  120  6e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.13 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  31.1 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.7 
 
 		 422 aa  95.9  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  29.63 
 
 		 437 aa  94.7  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  30.9 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  28.16 
 
 		 444 aa  92  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.21 
 
 		 382 aa  90.9  4e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  32.04 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  32.04 
 
 		 435 aa  88.6  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  31.4 
 
 		 445 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  29.31 
 
 		 426 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  28.69 
 
 		 444 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  28.29 
 
 		 433 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  33.94 
 
 		 435 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  28.48 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  28.43 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  28.42 
 
 		 444 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 447 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  27.61 
 
 		 451 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  28.53 
 
 		 450 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.93 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  29.19 
 
 		 449 aa  80.1  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  27.93 
 
 		 446 aa  80.1  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  27.93 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  27.03 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  26.93 
 
 		 622 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  29.82 
 
 		 408 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  27.03 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  27.03 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  27.03 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  27.03 
 
 		 450 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  26.07 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25.91 
 
 		 433 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  27.17 
 
 		 442 aa  77.8  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  27.01 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25.57 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  25.8 
 
 		 433 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25.57 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  24.29 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  24.29 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  24.29 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  24.29 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  24.29 
 
 		 440 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  28.23 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  27.59 
 
 		 446 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.8 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  30.49 
 
 		 439 aa  75.5  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.78 
 
 		 419 aa  74.7  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  26.77 
 
 		 362 aa  74.3  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  30.17 
 
 		 440 aa  73.9  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  27.92 
 
 		 409 aa  73.9  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  26.13 
 
 		 446 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  25.14 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  26.56 
 
 		 438 aa  73.2  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  29.55 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  26.63 
 
 		 435 aa  72.8  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.28 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  30.66 
 
 		 412 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  29.11 
 
 		 439 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  26.42 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.95 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  26.53 
 
 		 380 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  31.27 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  25.17 
 
 		 435 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.22 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.22 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  29.61 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  25.92 
 
 		 444 aa  69.7  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  28.81 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  26.55 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  26.86 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.32 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  26.69 
 
 		 457 aa  67.8  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  31.34 
 
 		 454 aa  67.8  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.97 
 
 		 434 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  29.25 
 
 		 453 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>