176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp1915 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  100 
 
 
431 aa  894    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  44.88 
 
 
433 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  42.09 
 
 
433 aa  341  2e-92  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  42.96 
 
 
434 aa  341  2e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  41.67 
 
 
433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  41.44 
 
 
433 aa  338  8e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  41.86 
 
 
433 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  41.69 
 
 
423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  42.48 
 
 
433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  42.86 
 
 
435 aa  335  9e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  38.28 
 
 
450 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  38.66 
 
 
450 aa  280  3e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  38.07 
 
 
453 aa  270  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  34.21 
 
 
456 aa  238  2e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  37.7 
 
 
451 aa  233  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1904  hypothetical protein  95.92 
 
 
98 aa  196  1e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.31 
 
 
414 aa  166  9e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  30.66 
 
 
422 aa  164  4.0000000000000004e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  33.05 
 
 
416 aa  159  7e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  32.34 
 
 
460 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  33.03 
 
 
433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28.61 
 
 
454 aa  156  7e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  29.63 
 
 
422 aa  146  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  27.78 
 
 
418 aa  141  3e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.03 
 
 
382 aa  140  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  30.93 
 
 
440 aa  136  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  29.85 
 
 
434 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  29.85 
 
 
434 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.64 
 
 
434 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.39 
 
 
434 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  29.3 
 
 
430 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  29.45 
 
 
430 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  26.23 
 
 
362 aa  116  7.999999999999999e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  28.24 
 
 
435 aa  115  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  26.83 
 
 
461 aa  112  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  28.99 
 
 
449 aa  112  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  25.38 
 
 
437 aa  110  6e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  27.93 
 
 
440 aa  105  1e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.34 
 
 
425 aa  104  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  28.29 
 
 
439 aa  104  3e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  29.72 
 
 
451 aa  103  5e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  29.33 
 
 
438 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  28.7 
 
 
440 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  28.7 
 
 
440 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  28.88 
 
 
433 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  28.7 
 
 
440 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  28.7 
 
 
440 aa  101  2e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  28.7 
 
 
440 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  29.66 
 
 
439 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  26.56 
 
 
411 aa  99  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  30.18 
 
 
440 aa  98.2  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  29.05 
 
 
435 aa  97.8  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  24.22 
 
 
480 aa  97.4  4e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  26.05 
 
 
426 aa  96.3  9e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  30.56 
 
 
440 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  26.18 
 
 
427 aa  95.1  2e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  27.07 
 
 
439 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  26.78 
 
 
445 aa  91.7  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  26.73 
 
 
412 aa  91.7  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  26.49 
 
 
449 aa  91.3  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  25.19 
 
 
450 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  27 
 
 
445 aa  90.1  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  25 
 
 
435 aa  90.1  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  25 
 
 
435 aa  90.1  7e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  26.39 
 
 
419 aa  90.1  7e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  28.14 
 
 
446 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.75 
 
 
435 aa  86.7  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  25.23 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  35.85 
 
 
420 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.96 
 
 
440 aa  85.5  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  27.52 
 
 
351 aa  85.5  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  26.61 
 
 
435 aa  83.6  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  23.92 
 
 
427 aa  82.4  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  24.61 
 
 
408 aa  82.8  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  26.26 
 
 
441 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  25.8 
 
 
413 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  25.94 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  23.13 
 
 
404 aa  82  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  26.2 
 
 
447 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  28.24 
 
 
418 aa  80.5  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  25.38 
 
 
434 aa  80.1  0.00000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  26.37 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  26.25 
 
 
446 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  25.99 
 
 
444 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  26.5 
 
 
446 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  27.24 
 
 
450 aa  79  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  25.53 
 
 
440 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  25.99 
 
 
444 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  26.96 
 
 
444 aa  77  0.0000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  25.25 
 
 
444 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  28.16 
 
 
413 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  26.43 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  25.91 
 
 
446 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  25 
 
 
413 aa  75.5  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  24.7 
 
 
442 aa  75.5  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  25.35 
 
 
443 aa  73.9  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  23.84 
 
 
400 aa  73.6  0.000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  24.72 
 
 
409 aa  73.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  25.58 
 
 
418 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  24.62 
 
 
444 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>