181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_1983 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  100 
 
 
420 aa  877    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  48.21 
 
 
440 aa  402  1e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  47.98 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  47.09 
 
 
419 aa  389  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  52.77 
 
 
387 aa  391  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  49.52 
 
 
430 aa  390  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  46.88 
 
 
430 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  47.2 
 
 
387 aa  359  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  39.76 
 
 
411 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  38.28 
 
 
430 aa  209  1e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  33.59 
 
 
412 aa  204  3e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  34.03 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  32.51 
 
 
435 aa  196  6e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  32.91 
 
 
420 aa  193  4e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  32.43 
 
 
412 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  31.18 
 
 
460 aa  170  4e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  32.34 
 
 
431 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  32.26 
 
 
407 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  35.44 
 
 
415 aa  153  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  36.49 
 
 
417 aa  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  32.58 
 
 
415 aa  150  3e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  32.38 
 
 
429 aa  150  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  30.29 
 
 
404 aa  146  9e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  32.98 
 
 
418 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  33.77 
 
 
414 aa  145  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  31.23 
 
 
420 aa  143  5e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  34.09 
 
 
415 aa  142  9e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  31.68 
 
 
409 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  30.21 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  31.14 
 
 
405 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  28.85 
 
 
421 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  31.33 
 
 
407 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  33.66 
 
 
390 aa  133  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  29.88 
 
 
330 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  30 
 
 
441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  31.71 
 
 
414 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  32.25 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  29.89 
 
 
415 aa  126  6e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  29.47 
 
 
423 aa  126  8.000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  29.66 
 
 
431 aa  126  9e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  30.77 
 
 
414 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  30.05 
 
 
435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.54 
 
 
410 aa  119  7e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  30.5 
 
 
434 aa  116  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  28.96 
 
 
414 aa  115  2.0000000000000002e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  25.07 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  30.43 
 
 
408 aa  110  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  28.64 
 
 
433 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  31.03 
 
 
414 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  28.62 
 
 
405 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  26.56 
 
 
418 aa  97.4  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.69 
 
 
460 aa  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  27.07 
 
 
418 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  29.7 
 
 
431 aa  86.3  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  25.36 
 
 
435 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  27.91 
 
 
411 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  27.5 
 
 
433 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  33.96 
 
 
295 aa  79.7  0.00000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  24.64 
 
 
435 aa  79  0.0000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  26.16 
 
 
434 aa  77  0.0000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  33.79 
 
 
433 aa  75.5  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  26.13 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  23.19 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  26.29 
 
 
444 aa  74.7  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  23.19 
 
 
419 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  25.33 
 
 
380 aa  74.3  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.54 
 
 
382 aa  73.2  0.000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.85 
 
 
439 aa  72.4  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  26.67 
 
 
432 aa  71.6  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  25 
 
 
392 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  28.7 
 
 
429 aa  72  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  25.91 
 
 
430 aa  71.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  32.28 
 
 
443 aa  69.3  0.0000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  25.14 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  33.7 
 
 
419 aa  69.7  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0727  hypothetical protein  29.63 
 
 
443 aa  68.6  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.13683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.98 
 
 
424 aa  67  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  24.63 
 
 
419 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  24.93 
 
 
433 aa  65.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30 
 
 
430 aa  64.7  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  23.46 
 
 
419 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  23.5 
 
 
430 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  25.78 
 
 
425 aa  63.9  0.000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  32.03 
 
 
312 aa  63.5  0.000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.43 
 
 
434 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.43 
 
 
434 aa  63.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  28.44 
 
 
391 aa  62.8  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  27.27 
 
 
480 aa  62  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  28.75 
 
 
451 aa  62  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  31.48 
 
 
422 aa  61.6  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  25.08 
 
 
454 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  27.33 
 
 
433 aa  61.6  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  26.06 
 
 
409 aa  61.6  0.00000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  24.57 
 
 
429 aa  61.2  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  22.73 
 
 
453 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.74 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  23.33 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.74 
 
 
433 aa  60.8  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  32.5 
 
 
152 aa  60.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  26.09 
 
 
423 aa  60.1  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>