203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6813 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  77.81 
 
 		 413 aa  644    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 		 418 aa  849    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  73.88 
 
 		 413 aa  622  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  63.83 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  37.93 
 
 		 404 aa  261  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  37.47 
 
 		 400 aa  253  4.0000000000000004e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  37.69 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  31.29 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  34.29 
 
 		 415 aa  186  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  33.25 
 
 		 420 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  32.83 
 
 		 420 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  32.75 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  32.83 
 
 		 420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  32.43 
 
 		 420 aa  173  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  32.56 
 
 		 430 aa  152  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  34.7 
 
 		 447 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  32.05 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  29.27 
 
 		 433 aa  140  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  29.84 
 
 		 443 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  30.42 
 
 		 437 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  30.33 
 
 		 437 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  31.28 
 
 		 422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  29.43 
 
 		 448 aa  129  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  33.52 
 
 		 453 aa  120  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  30.69 
 
 		 408 aa  117  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  33.14 
 
 		 409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  28.32 
 
 		 414 aa  109  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  26.54 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  26.54 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  26.54 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  26.54 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  26.54 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  30.99 
 
 		 251 aa  104  3e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  32.27 
 
 		 418 aa  103  8e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  25.66 
 
 		 427 aa  102  9e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 		 402 aa  102  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  30.72 
 
 		 381 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  26.4 
 
 		 435 aa  99  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  31.51 
 
 		 439 aa  98.6  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  28.57 
 
 		 435 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  25.96 
 
 		 425 aa  97.1  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  24.42 
 
 		 426 aa  97.4  5e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.76 
 
 		 433 aa  97.1  6e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  26.44 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  29.09 
 
 		 312 aa  96.3  8e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  29.28 
 
 		 430 aa  95.9  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  27.35 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  31.07 
 
 		 460 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28.74 
 
 		 454 aa  95.9  1e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  27.35 
 
 		 434 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  26.44 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  26.44 
 
 		 435 aa  93.2  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  27.25 
 
 		 437 aa  92.8  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  27.2 
 
 		 439 aa  93.2  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  31.37 
 
 		 396 aa  93.2  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  29.62 
 
 		 447 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  26.47 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 		 434 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  26.77 
 
 		 461 aa  92.8  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  28.69 
 
 		 440 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  28.42 
 
 		 446 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  27.7 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.82 
 
 		 439 aa  90.5  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.79 
 
 		 433 aa  90.5  5e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  27.75 
 
 		 433 aa  90.1  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  27.27 
 
 		 403 aa  90.1  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  27.51 
 
 		 435 aa  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  26.81 
 
 		 445 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  25.24 
 
 		 438 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  28.65 
 
 		 430 aa  89.4  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  28.68 
 
 		 440 aa  89.4  1e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  27.38 
 
 		 450 aa  86.7  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  27.71 
 
 		 425 aa  86.3  9e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  26.26 
 
 		 423 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  26.69 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.54 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  25.82 
 
 		 440 aa  85.1  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  27.3 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  27.59 
 
 		 435 aa  84.7  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25.98 
 
 		 433 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  25.18 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  24.86 
 
 		 440 aa  82.8  0.000000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  26.99 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  33.79 
 
 		 305 aa  82  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  24.38 
 
 		 439 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  28.24 
 
 		 431 aa  80.5  0.00000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  26.35 
 
 		 443 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  23.62 
 
 		 382 aa  80.5  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  24.7 
 
 		 457 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  28.83 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  24.02 
 
 		 480 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  28.83 
 
 		 446 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  28.83 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  27.59 
 
 		 446 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  28.75 
 
 		 446 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  25 
 
 		 434 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  29.11 
 
 		 312 aa  78.2  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  26.38 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>