166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4800 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  100 
 
 		 453 aa  924    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  48.63 
 
 		 448 aa  390  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  50.11 
 
 		 432 aa  390  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  47.43 
 
 		 447 aa  367  1e-100  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  33.65 
 
 		 433 aa  173  5e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  31.35 
 
 		 443 aa  167  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  35.08 
 
 		 437 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  35.08 
 
 		 437 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  31.62 
 
 		 420 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  31.91 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  31.62 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.7 
 
 		 418 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  31.62 
 
 		 420 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  31.34 
 
 		 420 aa  131  3e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  29.78 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  29.78 
 
 		 430 aa  127  6e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  32.87 
 
 		 413 aa  126  1e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  31.02 
 
 		 415 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  32.01 
 
 		 413 aa  124  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  33.52 
 
 		 418 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  32.35 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  32.47 
 
 		 404 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  29.68 
 
 		 413 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  31.54 
 
 		 422 aa  87  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  27.18 
 
 		 426 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  34.97 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  30.51 
 
 		 412 aa  82.8  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  28.52 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  27.67 
 
 		 382 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  28.42 
 
 		 433 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  25.66 
 
 		 427 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  24.42 
 
 		 439 aa  67.8  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  26.97 
 
 		 435 aa  67.8  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  28 
 
 		 312 aa  67  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  26.22 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  27.41 
 
 		 390 aa  66.6  0.0000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  26.98 
 
 		 447 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  25.63 
 
 		 446 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  24.66 
 
 		 480 aa  63.9  0.000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  25.86 
 
 		 439 aa  63.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  26.46 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  24.75 
 
 		 381 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  31.85 
 
 		 318 aa  63.2  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  26.3 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  27.21 
 
 		 435 aa  62.4  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  25.35 
 
 		 395 aa  62  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  27.09 
 
 		 449 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  31.85 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  29.68 
 
 		 317 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  24.35 
 
 		 409 aa  60.8  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  29.73 
 
 		 312 aa  60.1  0.00000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  28.3 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  26.58 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  26.58 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  37.14 
 
 		 251 aa  59.3  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  26.58 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.27 
 
 		 408 aa  59.3  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  27.5 
 
 		 433 aa  59.3  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  26.58 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30.43 
 
 		 414 aa  59.3  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  25.87 
 
 		 454 aa  59.7  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  26.58 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 422 aa  58.9  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  27.89 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  25.49 
 
 		 421 aa  58.9  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.65 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  27.46 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  28.43 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  28.43 
 
 		 435 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  27.62 
 
 		 446 aa  57.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  30.43 
 
 		 415 aa  57.8  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  29.08 
 
 		 443 aa  57.4  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  29.81 
 
 		 409 aa  57.4  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  27.09 
 
 		 412 aa  57  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  27.01 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  25.44 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.07 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  32.62 
 
 		 412 aa  55.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  28.11 
 
 		 441 aa  55.8  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  23.47 
 
 		 418 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  26.32 
 
 		 396 aa  55.8  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  23.42 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  23.37 
 
 		 430 aa  55.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  23.09 
 
 		 438 aa  55.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  27.36 
 
 		 457 aa  55.1  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0242  HipA-like-like  29.9 
 
 		 526 aa  54.3  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.430358  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25.29 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  30.29 
 
 		 420 aa  54.7  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 433 aa  54.7  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.29 
 
 		 433 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  24.14 
 
 		 430 aa  53.9  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  24.83 
 
 		 435 aa  53.5  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  26.77 
 
 		 425 aa  53.5  0.000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  28.03 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  29.51 
 
 		 439 aa  53.5  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  24.21 
 
 		 435 aa  53.5  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.58 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  22.77 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  23.68 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  25.92 
 
 		 446 aa  52.8  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>