199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_04052 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  100 
 
 		 400 aa  824    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  88.75 
 
 		 404 aa  735    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  43.92 
 
 		 437 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  37.97 
 
 		 413 aa  266  4e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  37.47 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  37.69 
 
 		 413 aa  248  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  37.7 
 
 		 413 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  31.85 
 
 		 418 aa  216  8e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  34.07 
 
 		 420 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  33.82 
 
 		 420 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  33.82 
 
 		 420 aa  206  6e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  33.58 
 
 		 420 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  32.75 
 
 		 415 aa  170  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  32.29 
 
 		 433 aa  167  2e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  29.51 
 
 		 430 aa  166  8e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  31.06 
 
 		 443 aa  156  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  30.62 
 
 		 437 aa  141  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  31.48 
 
 		 437 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  33.79 
 
 		 447 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.73 
 
 		 422 aa  132  9e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  30.11 
 
 		 432 aa  132  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  28.27 
 
 		 448 aa  119  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  32.35 
 
 		 453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  31.99 
 
 		 434 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  31.99 
 
 		 434 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  34.04 
 
 		 434 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  34.04 
 
 		 434 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  28.83 
 
 		 425 aa  102  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  27.17 
 
 		 408 aa  100  6e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  30.53 
 
 		 430 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  32.84 
 
 		 312 aa  96.7  6e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  30.56 
 
 		 460 aa  95.9  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  29.54 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  31.17 
 
 		 318 aa  94.4  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.71 
 
 		 433 aa  94  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  30.77 
 
 		 318 aa  93.6  6e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  25.27 
 
 		 426 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  28.14 
 
 		 317 aa  90.1  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  27.02 
 
 		 440 aa  89.7  8e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  29.19 
 
 		 440 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  29.08 
 
 		 409 aa  88.2  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1275  hypothetical protein  27.71 
 
 		 425 aa  87.4  4e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.370797  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  28.88 
 
 		 251 aa  87.4  4e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  28.32 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  27.42 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  27.42 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  27.42 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  27.42 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  26.15 
 
 		 438 aa  86.7  6e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  27.42 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  26.15 
 
 		 382 aa  87  6e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  30.14 
 
 		 430 aa  86.7  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  27.21 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  27.59 
 
 		 312 aa  84.7  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  25.33 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  24.93 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.57 
 
 		 419 aa  83.6  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  26.12 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28.19 
 
 		 454 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  27.71 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  27.18 
 
 		 362 aa  81.3  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  25.89 
 
 		 446 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  26.2 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  26.26 
 
 		 395 aa  80.1  0.00000000000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  25.14 
 
 		 416 aa  80.1  0.00000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  25.23 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  27.97 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  27.02 
 
 		 613 aa  79  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  25.51 
 
 		 461 aa  79.3  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  29.32 
 
 		 450 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  26.42 
 
 		 444 aa  78.2  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  26.79 
 
 		 403 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  26.78 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  28.67 
 
 		 437 aa  77.4  0.0000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  25.9 
 
 		 422 aa  77.4  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  30.24 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  25.28 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  26.17 
 
 		 439 aa  76.3  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.27 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  28.43 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  28.76 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  28.76 
 
 		 423 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  27.24 
 
 		 435 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  26.35 
 
 		 380 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  29.04 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  25.94 
 
 		 351 aa  73.9  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  29.41 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.54 
 
 		 435 aa  74.3  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  23.84 
 
 		 431 aa  73.6  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.35 
 
 		 446 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  25.63 
 
 		 440 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  25.32 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  25.32 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  25.32 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  26.26 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  26.25 
 
 		 402 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 433 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  26.26 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5430  HipA N-terminal domain protein  28.92 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.875392 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>