194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4571 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  100 
 
 
437 aa  889    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  44.99 
 
 
404 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  43.92 
 
 
400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  38.54 
 
 
413 aa  224  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  34.54 
 
 
420 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  34.54 
 
 
420 aa  220  3e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  34.3 
 
 
420 aa  219  6e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  37.69 
 
 
418 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  34.3 
 
 
420 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  34.3 
 
 
420 aa  218  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  32.68 
 
 
418 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0687  HipA-like protein  37.28 
 
 
413 aa  210  4e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  37.22 
 
 
413 aa  209  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  33.25 
 
 
415 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  33.73 
 
 
430 aa  180  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  35.19 
 
 
433 aa  178  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  32.86 
 
 
437 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  32.63 
 
 
437 aa  164  3e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  30.27 
 
 
443 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  32.23 
 
 
432 aa  145  2e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2649  HipA-like  34.23 
 
 
447 aa  142  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.354329  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5419  HipA-like  29.73 
 
 
448 aa  130  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4800  HipA N-terminal domain protein  31.73 
 
 
453 aa  127  5e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  28.22 
 
 
422 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  27.7 
 
 
454 aa  105  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.06 
 
 
414 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2292  hypothetical protein  30.19 
 
 
312 aa  97.8  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  29.97 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  29.79 
 
 
434 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  32.92 
 
 
318 aa  97.4  4e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  33.97 
 
 
318 aa  97.1  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  29.79 
 
 
434 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2166  HipA domain protein  31.8 
 
 
317 aa  95.1  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0895292  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.86 
 
 
434 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.86 
 
 
434 aa  94  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  29.55 
 
 
440 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  29.55 
 
 
440 aa  94  5e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  29.55 
 
 
440 aa  94  5e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  29.55 
 
 
440 aa  94  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  29.55 
 
 
440 aa  94  5e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  29.51 
 
 
425 aa  92.4  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  28.28 
 
 
419 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  29.73 
 
 
435 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  27.86 
 
 
409 aa  89.7  8e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0153  HipA domain protein  34.45 
 
 
305 aa  87.4  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  25.57 
 
 
382 aa  87.8  4e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  26.37 
 
 
411 aa  87.4  5e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  29.32 
 
 
418 aa  87  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.97 
 
 
430 aa  86.7  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  29.06 
 
 
435 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  28.57 
 
 
312 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  25.34 
 
 
433 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3810  HipA domain-containing protein  27.1 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.842886  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  25.28 
 
 
433 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  25.34 
 
 
433 aa  84  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  28.35 
 
 
422 aa  83.2  0.000000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  26.93 
 
 
362 aa  82.8  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  27.54 
 
 
418 aa  82.8  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25.7 
 
 
433 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  27.94 
 
 
403 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  25.75 
 
 
435 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  29.9 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  28.24 
 
 
439 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  27.17 
 
 
430 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  25.7 
 
 
433 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25.41 
 
 
423 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  29.45 
 
 
440 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  28.7 
 
 
396 aa  80.5  0.00000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  35.14 
 
 
407 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  26.77 
 
 
451 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.83 
 
 
434 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  27.93 
 
 
435 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  27.22 
 
 
440 aa  77  0.0000000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  27.19 
 
 
435 aa  77  0.0000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  27.05 
 
 
435 aa  74.7  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2046  HipA domain protein  32.78 
 
 
251 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  30.09 
 
 
450 aa  72.8  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  27.07 
 
 
412 aa  72  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  25.88 
 
 
431 aa  72  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  26.61 
 
 
395 aa  71.2  0.00000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  24.57 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  27.42 
 
 
449 aa  71.2  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  27.04 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  28.24 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.47 
 
 
433 aa  70.1  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  30.86 
 
 
351 aa  70.1  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  24.88 
 
 
439 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  27.01 
 
 
460 aa  68.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  30.95 
 
 
318 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  31.86 
 
 
427 aa  67.4  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 
444 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4056  HipA-like  28.79 
 
 
613 aa  67  0.0000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.970389  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0205  hypothetical protein  27.65 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  28.28 
 
 
439 aa  66.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  24.43 
 
 
427 aa  66.2  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  30.43 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  27.44 
 
 
433 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  29 
 
 
440 aa  65.5  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3446  HipA domain-containing protein  28.8 
 
 
617 aa  65.5  0.000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>