166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0156 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  100 
 
 
433 aa  894    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  56.81 
 
 
435 aa  498  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  53.58 
 
 
437 aa  460  9.999999999999999e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  46.6 
 
 
439 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  46.26 
 
 
441 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  46.59 
 
 
443 aa  364  2e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  43.66 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  46.52 
 
 
447 aa  352  1e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  42.66 
 
 
439 aa  350  3e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  46.22 
 
 
446 aa  350  4e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  42.48 
 
 
434 aa  344  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  41.71 
 
 
435 aa  338  8e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  44.01 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  40.46 
 
 
439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  47.33 
 
 
450 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  40.18 
 
 
438 aa  330  4e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  43.71 
 
 
449 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  42.01 
 
 
442 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  43.78 
 
 
445 aa  325  1e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  42.43 
 
 
444 aa  322  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  41.1 
 
 
440 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  41.1 
 
 
440 aa  317  2e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  41.1 
 
 
440 aa  317  2e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  41.1 
 
 
440 aa  317  2e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  41.1 
 
 
440 aa  317  2e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  42.99 
 
 
444 aa  317  3e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  39.86 
 
 
440 aa  316  5e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  41.29 
 
 
444 aa  316  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  42.82 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  42.82 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  42.82 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  42.82 
 
 
450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  42.82 
 
 
450 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  42.82 
 
 
622 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  41.19 
 
 
444 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  42.59 
 
 
435 aa  312  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  42.59 
 
 
435 aa  312  5.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  42.14 
 
 
450 aa  312  7.999999999999999e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  44.83 
 
 
380 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  44.03 
 
 
445 aa  310  5e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  41.29 
 
 
444 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  40.69 
 
 
441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  41.88 
 
 
440 aa  305  1.0000000000000001e-81  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  41.07 
 
 
446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  41.46 
 
 
446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  41.16 
 
 
446 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  41.46 
 
 
446 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  40.98 
 
 
440 aa  300  3e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  41.22 
 
 
446 aa  295  1e-78  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  41.18 
 
 
440 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  41.98 
 
 
351 aa  252  1e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  34.48 
 
 
435 aa  238  2e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  37.33 
 
 
425 aa  205  1e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  32.49 
 
 
414 aa  171  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  31.36 
 
 
480 aa  171  3e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  32.16 
 
 
426 aa  169  9e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  34.53 
 
 
382 aa  168  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  33.95 
 
 
461 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  30.92 
 
 
422 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  32.65 
 
 
427 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  32.89 
 
 
435 aa  144  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  31.1 
 
 
411 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28.75 
 
 
454 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  30.61 
 
 
422 aa  130  7.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  30.58 
 
 
418 aa  125  1e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  31.45 
 
 
450 aa  123  7e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  26.35 
 
 
450 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.79 
 
 
433 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  27.74 
 
 
423 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  27.74 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  31.56 
 
 
449 aa  114  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.16 
 
 
433 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  28.85 
 
 
433 aa  112  9e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  27.23 
 
 
433 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  28.64 
 
 
419 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  28.34 
 
 
433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  29.67 
 
 
430 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  26.23 
 
 
435 aa  110  5e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  30.3 
 
 
460 aa  110  5e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  36.08 
 
 
176 aa  110  6e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  27.6 
 
 
362 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  28.18 
 
 
416 aa  108  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  26.85 
 
 
427 aa  107  4e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  25.18 
 
 
434 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  27.89 
 
 
453 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.53 
 
 
433 aa  104  3e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  28.49 
 
 
430 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  28.88 
 
 
431 aa  101  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  26.49 
 
 
451 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  41.38 
 
 
222 aa  100  6e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.44 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.44 
 
 
434 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  26.2 
 
 
408 aa  98.2  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  44.04 
 
 
116 aa  96.7  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.14 
 
 
434 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.14 
 
 
434 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  30.06 
 
 
451 aa  94  5e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  28.66 
 
 
440 aa  93.6  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  28.79 
 
 
456 aa  93.2  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  26.45 
 
 
415 aa  90.5  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>