219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03586 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03586  HipA  100 
 
 
425 aa  869    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  39.79 
 
 
426 aa  245  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  39.07 
 
 
450 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  37.74 
 
 
434 aa  221  1.9999999999999999e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  38.71 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  38.71 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  38.71 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  38.71 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  38.71 
 
 
440 aa  220  3.9999999999999997e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  36.93 
 
 
435 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  39.06 
 
 
437 aa  213  4.9999999999999996e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  35.29 
 
 
480 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  37.33 
 
 
433 aa  205  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  34.84 
 
 
446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  32.95 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  32.25 
 
 
438 aa  199  6e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  32.22 
 
 
442 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  37.99 
 
 
461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  34.39 
 
 
435 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  32.19 
 
 
441 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  34.39 
 
 
435 aa  197  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  37.01 
 
 
440 aa  197  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  38.46 
 
 
446 aa  197  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  32.7 
 
 
444 aa  196  8.000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  35.11 
 
 
439 aa  196  8.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  36.39 
 
 
440 aa  196  9e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  37.5 
 
 
422 aa  192  7e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  32.01 
 
 
439 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  32.16 
 
 
440 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  35.07 
 
 
449 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  33.25 
 
 
414 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  30.57 
 
 
435 aa  190  4e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  36.19 
 
 
447 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  36.03 
 
 
445 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  32.09 
 
 
441 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  31.07 
 
 
439 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  31.81 
 
 
427 aa  180  4e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  33.25 
 
 
444 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  35.88 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  32.69 
 
 
444 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  33.18 
 
 
443 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  34.9 
 
 
450 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  34.9 
 
 
450 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  34.9 
 
 
450 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  34.9 
 
 
450 aa  172  9e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  34.9 
 
 
450 aa  172  9e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  33.52 
 
 
446 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  34.9 
 
 
622 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  33.52 
 
 
446 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  33.52 
 
 
446 aa  170  5e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  34.25 
 
 
446 aa  169  9e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  33.61 
 
 
444 aa  169  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  33.51 
 
 
445 aa  167  4e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  33.25 
 
 
382 aa  167  4e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  33.62 
 
 
444 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  33.52 
 
 
450 aa  167  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  31.65 
 
 
440 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  38.79 
 
 
435 aa  164  3e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  38.98 
 
 
351 aa  161  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  32.13 
 
 
454 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  29.22 
 
 
435 aa  158  2e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  34.78 
 
 
380 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  30.47 
 
 
411 aa  156  7e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  34.83 
 
 
449 aa  152  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  33.43 
 
 
433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  30.45 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  30.45 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  30.45 
 
 
433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  28.73 
 
 
435 aa  126  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  30.45 
 
 
433 aa  125  1e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  30.91 
 
 
430 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  30.15 
 
 
423 aa  124  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  30.15 
 
 
433 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  30.83 
 
 
362 aa  123  6e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  31.73 
 
 
453 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  31.86 
 
 
418 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  29.31 
 
 
450 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.85 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  30.06 
 
 
450 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  32.92 
 
 
460 aa  117  3.9999999999999997e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  28.72 
 
 
419 aa  116  8.999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.73 
 
 
433 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  30.31 
 
 
430 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  29.53 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  27.08 
 
 
434 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  26.95 
 
 
427 aa  108  2e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  28.92 
 
 
434 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  28.92 
 
 
434 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.65 
 
 
434 aa  107  5e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  29.67 
 
 
404 aa  104  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.38 
 
 
434 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  27.34 
 
 
431 aa  104  3e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  28.83 
 
 
400 aa  102  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  33.22 
 
 
412 aa  100  5e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  27.61 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  29.21 
 
 
451 aa  98.6  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  31.1 
 
 
430 aa  98.2  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  28.22 
 
 
420 aa  96.7  7e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  27.95 
 
 
451 aa  96.7  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 
420 aa  95.9  1e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>