207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_30640 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  100 
 
 
433 aa  874    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  56.32 
 
 
440 aa  434  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  51.73 
 
 
460 aa  433  1e-120  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  44.67 
 
 
430 aa  346  5e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  45.31 
 
 
430 aa  345  7e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  43.55 
 
 
434 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  43.32 
 
 
434 aa  317  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  42.63 
 
 
434 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  42.63 
 
 
434 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  36.04 
 
 
450 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  36.04 
 
 
450 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  39.14 
 
 
422 aa  193  6e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  39.83 
 
 
416 aa  190  4e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  38.72 
 
 
451 aa  180  4.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  37.54 
 
 
414 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  32.54 
 
 
453 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  32.49 
 
 
450 aa  167  5e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  35.71 
 
 
422 aa  163  5.0000000000000005e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  33.96 
 
 
433 aa  162  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  33.64 
 
 
433 aa  160  4e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  33.64 
 
 
433 aa  160  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  33.75 
 
 
423 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  33.33 
 
 
433 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  33.64 
 
 
433 aa  157  3e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  33.03 
 
 
431 aa  157  5.0000000000000005e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  34.8 
 
 
435 aa  155  9e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  34.16 
 
 
433 aa  155  2e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  37.28 
 
 
456 aa  153  5e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  33.86 
 
 
434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  31.08 
 
 
437 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  34.6 
 
 
440 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  34.96 
 
 
435 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  35.45 
 
 
418 aa  132  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  34.96 
 
 
435 aa  132  9e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2508  hypothetical protein  27.33 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.020002 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  33.43 
 
 
425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  35.08 
 
 
382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  31.39 
 
 
426 aa  130  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  32.1 
 
 
461 aa  129  7.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  32.25 
 
 
440 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  32.25 
 
 
440 aa  126  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  32.25 
 
 
440 aa  126  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  32.25 
 
 
440 aa  126  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  32.25 
 
 
440 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  32.94 
 
 
440 aa  126  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  31.25 
 
 
440 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  32.68 
 
 
446 aa  122  9e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  33.33 
 
 
454 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2776  HipA domain protein  26.27 
 
 
436 aa  121  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.56 
 
 
449 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2372  HipA domain protein  26.22 
 
 
436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  32.14 
 
 
446 aa  118  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  31.76 
 
 
446 aa  114  3e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  30.79 
 
 
435 aa  113  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  31.91 
 
 
438 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  25.81 
 
 
434 aa  112  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  31.56 
 
 
446 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  29.93 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  30.26 
 
 
446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  29.93 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  29.93 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  29.93 
 
 
450 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  30.97 
 
 
446 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  30.82 
 
 
427 aa  110  7.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  32.63 
 
 
435 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  28.27 
 
 
442 aa  109  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  30.77 
 
 
447 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  31.37 
 
 
435 aa  109  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  31.25 
 
 
362 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  29.69 
 
 
622 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  29.69 
 
 
450 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  27.74 
 
 
435 aa  108  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  31.36 
 
 
446 aa  108  3e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  28.19 
 
 
444 aa  107  3e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  30.95 
 
 
444 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  29.71 
 
 
439 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  30.2 
 
 
441 aa  106  8e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  30.15 
 
 
440 aa  106  8e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  31.01 
 
 
439 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  28.53 
 
 
433 aa  104  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  30.27 
 
 
444 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  30.27 
 
 
444 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  31.27 
 
 
441 aa  104  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  29.08 
 
 
439 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  30.91 
 
 
443 aa  100  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  30.12 
 
 
480 aa  99.8  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  30.3 
 
 
408 aa  97.8  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  27.97 
 
 
444 aa  97.8  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  33.04 
 
 
445 aa  96.7  7e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  29.67 
 
 
450 aa  96.7  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  29.57 
 
 
419 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  29.61 
 
 
412 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  28.12 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  30.65 
 
 
413 aa  94.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  30.71 
 
 
400 aa  94  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  30.86 
 
 
451 aa  92.8  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  31.32 
 
 
404 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  30.28 
 
 
427 aa  92.8  1e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  30.89 
 
 
404 aa  92  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  27.14 
 
 
445 aa  91.3  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>