151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0635 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  99.56 
 
 
450 aa  899    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  100 
 
 
622 aa  1238    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  73.86 
 
 
444 aa  680    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  99.56 
 
 
450 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  99.56 
 
 
450 aa  899    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  99.78 
 
 
450 aa  902    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  99.56 
 
 
450 aa  899    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  69.91 
 
 
444 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  70.14 
 
 
444 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  68.76 
 
 
446 aa  598  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  68.03 
 
 
444 aa  599  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  68.18 
 
 
446 aa  595  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  68.04 
 
 
446 aa  592  1e-168  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  67.81 
 
 
446 aa  589  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  70.11 
 
 
380 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  61.06 
 
 
442 aa  547  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  59.95 
 
 
444 aa  529  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  54.3 
 
 
450 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  54.73 
 
 
446 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  52.66 
 
 
440 aa  438  1e-121  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  51.59 
 
 
447 aa  434  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  50.9 
 
 
446 aa  435  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  52.6 
 
 
445 aa  427  1e-118  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  52.82 
 
 
446 aa  424  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  48.74 
 
 
449 aa  421  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  49.88 
 
 
441 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  48.85 
 
 
441 aa  409  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  46.82 
 
 
439 aa  405  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  48.96 
 
 
445 aa  404  1e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  47.14 
 
 
440 aa  388  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  47.95 
 
 
440 aa  381  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  43.91 
 
 
434 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  43.34 
 
 
435 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  45.18 
 
 
438 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  43.41 
 
 
439 aa  362  1e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  47.21 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  47.21 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  44.62 
 
 
435 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  42.56 
 
 
439 aa  353  7e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  44.34 
 
 
437 aa  338  9.999999999999999e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  45.77 
 
 
435 aa  327  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  41.32 
 
 
440 aa  323  6e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  42.99 
 
 
433 aa  313  6.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  39.5 
 
 
440 aa  297  5e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  39.5 
 
 
440 aa  297  5e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  39.5 
 
 
440 aa  297  5e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  39.5 
 
 
440 aa  297  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  39.5 
 
 
440 aa  297  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  42.47 
 
 
450 aa  283  9e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  43.06 
 
 
443 aa  263  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  39.38 
 
 
351 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  30.99 
 
 
435 aa  204  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  34.31 
 
 
426 aa  180  7e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  34.66 
 
 
461 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  34.9 
 
 
425 aa  171  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  34.63 
 
 
411 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  32.71 
 
 
480 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  31.94 
 
 
427 aa  144  7e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  34.34 
 
 
422 aa  139  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  31.72 
 
 
414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.49 
 
 
454 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  30.34 
 
 
435 aa  121  3e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  30.11 
 
 
449 aa  120  9e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  36.87 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  34.19 
 
 
418 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  32.28 
 
 
422 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.84 
 
 
382 aa  110  6e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.94 
 
 
460 aa  110  9.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  29.69 
 
 
433 aa  107  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  31.96 
 
 
427 aa  101  5e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  47.32 
 
 
116 aa  100  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  28.45 
 
 
433 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  29.52 
 
 
433 aa  98.2  4e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  27.65 
 
 
450 aa  95.9  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  29.52 
 
 
433 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  45.22 
 
 
222 aa  95.1  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  26.94 
 
 
450 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  28.96 
 
 
433 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  28.96 
 
 
423 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  26.95 
 
 
435 aa  92.4  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  27.95 
 
 
433 aa  90.9  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  29.15 
 
 
416 aa  90.1  9e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.98 
 
 
430 aa  89.7  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  26.21 
 
 
434 aa  90.1  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  28.37 
 
 
362 aa  88.2  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  28.78 
 
 
430 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  28.37 
 
 
456 aa  81.3  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  29.59 
 
 
412 aa  80.9  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  27.73 
 
 
434 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  27.73 
 
 
434 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  29.78 
 
 
451 aa  79  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  26.93 
 
 
437 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  28.02 
 
 
453 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  26.93 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  26.62 
 
 
433 aa  77.4  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  26.79 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  26.97 
 
 
451 aa  75.5  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  26.53 
 
 
434 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1825  HipA N-terminal domain protein  28.62 
 
 
415 aa  73.2  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401045  normal  0.66095 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  27.49 
 
 
418 aa  72.8  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>