166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4059 on replicon NC_007489
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  100 
 
 		 451 aa  917    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  37.39 
 
 		 449 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  33.08 
 
 		 422 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  30.83 
 
 		 414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  31.66 
 
 		 454 aa  120  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  30.99 
 
 		 441 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  32.29 
 
 		 435 aa  111  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  31.14 
 
 		 426 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  30.79 
 
 		 382 aa  109  1e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  32.68 
 
 		 445 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  30.79 
 
 		 461 aa  107  3e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  29.72 
 
 		 431 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  29.28 
 
 		 435 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  29.92 
 
 		 434 aa  103  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  30.58 
 
 		 450 aa  102  1e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  29.58 
 
 		 439 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  27.71 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  31.65 
 
 		 440 aa  101  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  28.81 
 
 		 435 aa  101  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  29.97 
 
 		 419 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 433 aa  100  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  28.99 
 
 		 433 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  29.33 
 
 		 423 aa  100  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  29.33 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  28.89 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  28.89 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  28.89 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  28.89 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  28.66 
 
 		 433 aa  99  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  28.89 
 
 		 440 aa  99.4  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  29.21 
 
 		 425 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  31.78 
 
 		 437 aa  97.8  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  29.65 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  27.27 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  28.57 
 
 		 460 aa  97.1  5e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  28.21 
 
 		 438 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  30.81 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  30.81 
 
 		 435 aa  95.9  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  28.01 
 
 		 433 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  30.09 
 
 		 440 aa  95.5  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  26.42 
 
 		 456 aa  94  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  30.06 
 
 		 433 aa  94  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  30.19 
 
 		 440 aa  94  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  30.86 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  30.59 
 
 		 450 aa  92.4  1e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  26.32 
 
 		 439 aa  91.3  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  28.72 
 
 		 453 aa  91.7  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.579198 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  30.13 
 
 		 411 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  26.76 
 
 		 439 aa  89  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  28.42 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  27.3 
 
 		 427 aa  88.2  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  30 
 
 		 444 aa  88.2  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  30.54 
 
 		 446 aa  87.4  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  27.05 
 
 		 435 aa  87.8  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6296  HipA N-terminal domain-containing protein  29.51 
 
 		 408 aa  87.4  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  30.08 
 
 		 444 aa  86.7  7e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  29.29 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  28.82 
 
 		 430 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  29.53 
 
 		 444 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  29.89 
 
 		 441 aa  84.3  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  30.29 
 
 		 446 aa  84  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  27.61 
 
 		 422 aa  83.6  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2253  HipA domain-containing protein  27.46 
 
 		 437 aa  83.6  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.00653025  normal  0.641538 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  25.92 
 
 		 450 aa  83.2  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  30.91 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  30.56 
 
 		 446 aa  83.2  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  30 
 
 		 480 aa  83.2  0.000000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  28.7 
 
 		 412 aa  82.4  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  30.83 
 
 		 351 aa  82.8  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  28.88 
 
 		 418 aa  82.8  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1621  HipA N-terminal domain protein  27.61 
 
 		 437 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  32.5 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  28.73 
 
 		 444 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  30.57 
 
 		 443 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  27.43 
 
 		 442 aa  80.5  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  27.47 
 
 		 451 aa  80.1  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  29.78 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  29.78 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  29.78 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  29.78 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  29.78 
 
 		 450 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  29.78 
 
 		 622 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  29.02 
 
 		 445 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  29.38 
 
 		 444 aa  79.7  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  26.77 
 
 		 437 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  30.9 
 
 		 416 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  26.3 
 
 		 450 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  25 
 
 		 434 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  30.06 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  30.23 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  29.76 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  25.12 
 
 		 434 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0063  hypothetical protein  26.81 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  29.23 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  31.99 
 
 		 380 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  28.34 
 
 		 409 aa  71.6  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  31.44 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  26.82 
 
 		 440 aa  71.2  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.77 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.77 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>