164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4814 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  86.99 
 
 		 444 aa  800    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  100 
 
 		 442 aa  912    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  62.05 
 
 		 444 aa  558  1e-158  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  60.59 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  60.59 
 
 		 622 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  60.59 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  60.59 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  60.59 
 
 		 450 aa  545  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  60.59 
 
 		 450 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  59.4 
 
 		 444 aa  531  1e-149  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  58.28 
 
 		 444 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  58.28 
 
 		 444 aa  518  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  58.77 
 
 		 446 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  58.5 
 
 		 446 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  58.28 
 
 		 446 aa  512  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  57.99 
 
 		 446 aa  504  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  60.27 
 
 		 380 aa  477  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  52.49 
 
 		 450 aa  465  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  53.18 
 
 		 446 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  52.19 
 
 		 447 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  50.45 
 
 		 446 aa  437  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  50.12 
 
 		 440 aa  429  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  48.9 
 
 		 446 aa  418  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  48.05 
 
 		 434 aa  412  1e-114  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  47.89 
 
 		 439 aa  412  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  48.4 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  46.8 
 
 		 441 aa  409  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  47.83 
 
 		 435 aa  409  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  46.3 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  47.11 
 
 		 445 aa  393  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  47.05 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  47.05 
 
 		 435 aa  389  1e-107  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  45.8 
 
 		 449 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  44.37 
 
 		 439 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  45.12 
 
 		 445 aa  382  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  45.6 
 
 		 440 aa  376  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  43.05 
 
 		 438 aa  370  1e-101  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  41.61 
 
 		 439 aa  361  2e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  43.35 
 
 		 435 aa  359  7e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  43.22 
 
 		 440 aa  349  7e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  42.82 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  42.82 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  42.82 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  42.82 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  42.82 
 
 		 440 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  43.69 
 
 		 437 aa  335  7.999999999999999e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  42.01 
 
 		 433 aa  327  2.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  42.96 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  41.36 
 
 		 450 aa  318  1e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  39.82 
 
 		 443 aa  279  8e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  40.57 
 
 		 351 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  31.55 
 
 		 435 aa  211  2e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  32.22 
 
 		 425 aa  198  2.0000000000000003e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  33.26 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  32.73 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  29.67 
 
 		 480 aa  159  9e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  31.67 
 
 		 422 aa  150  5e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  32.14 
 
 		 427 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  30.95 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  32.39 
 
 		 414 aa  146  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  27.66 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  31.64 
 
 		 422 aa  129  9.000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  31.59 
 
 		 418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  30.7 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  37.57 
 
 		 176 aa  117  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  29.12 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  28.75 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  29.41 
 
 		 435 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  27.23 
 
 		 460 aa  111  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  28.79 
 
 		 434 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  28.05 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 		 433 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.45 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  28.4 
 
 		 416 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  28.27 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  27.8 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 		 423 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  28.06 
 
 		 449 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  42.74 
 
 		 222 aa  104  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  27.56 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  27.67 
 
 		 430 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  26.48 
 
 		 450 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  45.69 
 
 		 116 aa  97.8  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  27.83 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  25.54 
 
 		 434 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  25.54 
 
 		 434 aa  93.2  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.07 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  28.77 
 
 		 451 aa  90.1  6e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  26.4 
 
 		 450 aa  89.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 		 434 aa  87  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  26.2 
 
 		 434 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5936  HipA N-terminal domain protein  27.56 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.647866  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  25.71 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1629  hypothetical protein  26.8 
 
 		 443 aa  83.2  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  29.77 
 
 		 404 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  27.43 
 
 		 451 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  25.06 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4901  putative regulator containing a HipA-like domain  27.04 
 
 		 433 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.460954  normal  0.048459 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  24.51 
 
 		 409 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>