154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4520 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  83.37 
 
 
440 aa  763    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  100 
 
 
440 aa  907    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  54.44 
 
 
445 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  50.57 
 
 
435 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  50.57 
 
 
435 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  50.58 
 
 
444 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  52.08 
 
 
446 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  50.69 
 
 
444 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  50.92 
 
 
446 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  50.46 
 
 
446 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  47.95 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  50.46 
 
 
446 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  50.69 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  47.95 
 
 
450 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  49.43 
 
 
446 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  47.95 
 
 
622 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  47.95 
 
 
450 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  47.95 
 
 
450 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  47.95 
 
 
450 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  47.95 
 
 
450 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  48.76 
 
 
450 aa  394  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  47.34 
 
 
444 aa  388  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  45.6 
 
 
442 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  47.58 
 
 
447 aa  386  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  46.42 
 
 
441 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  49.77 
 
 
440 aa  385  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  45.37 
 
 
444 aa  384  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  45.6 
 
 
439 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  48.6 
 
 
446 aa  381  1e-104  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  43.71 
 
 
438 aa  378  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  42.63 
 
 
439 aa  366  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  44.63 
 
 
449 aa  360  2e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  43.84 
 
 
435 aa  361  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  43.02 
 
 
434 aa  353  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  48.17 
 
 
380 aa  352  7e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  43.65 
 
 
435 aa  351  2e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  43.74 
 
 
440 aa  346  5e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  44.47 
 
 
445 aa  345  8e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  44.52 
 
 
441 aa  339  5e-92  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  42.24 
 
 
439 aa  339  7e-92  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  43.6 
 
 
440 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  43.6 
 
 
440 aa  333  5e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  43.6 
 
 
440 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  43.6 
 
 
440 aa  333  5e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  43.6 
 
 
440 aa  333  5e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  42.82 
 
 
435 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  40.33 
 
 
437 aa  310  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  42.38 
 
 
450 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  44.13 
 
 
443 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  41.18 
 
 
433 aa  301  1e-80  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  41.57 
 
 
351 aa  246  6e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  34.29 
 
 
435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  37.01 
 
 
425 aa  206  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  37.28 
 
 
461 aa  194  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  35.58 
 
 
422 aa  170  4e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  34.72 
 
 
414 aa  163  6e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  34.5 
 
 
480 aa  155  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  34.83 
 
 
426 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  34.67 
 
 
427 aa  150  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  28.7 
 
 
454 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  32.91 
 
 
435 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30640  HipA protein  35.48 
 
 
433 aa  138  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  32.12 
 
 
449 aa  135  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0139  HipA N-terminal domain protein  33.54 
 
 
460 aa  134  3e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.388131 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  32.56 
 
 
411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3372  HipA domain-containing protein  32.29 
 
 
382 aa  129  8.000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0359  hypothetical protein  31.29 
 
 
427 aa  128  3e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  34.29 
 
 
418 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  30.43 
 
 
422 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  30.62 
 
 
416 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  39.1 
 
 
176 aa  113  8.000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  29.68 
 
 
430 aa  111  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  29.28 
 
 
434 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  29.28 
 
 
434 aa  110  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0479  HipA domain-containing protein  27.27 
 
 
433 aa  108  2e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  29.11 
 
 
430 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  27.23 
 
 
433 aa  105  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5391  HipA domain-containing protein  32.84 
 
 
440 aa  105  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326211  hitchhiker  0.00843465 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  28.41 
 
 
434 aa  104  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  27.23 
 
 
433 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  28.65 
 
 
433 aa  104  3e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  28.41 
 
 
434 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  46.85 
 
 
222 aa  103  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0568  hypothetical protein  50.47 
 
 
116 aa  102  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.116615  normal 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4059  hypothetical protein  30.75 
 
 
451 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4540  HipA domain-containing protein  29.22 
 
 
450 aa  100  4e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  27.27 
 
 
434 aa  100  4e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  27.95 
 
 
433 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  27.95 
 
 
423 aa  99.8  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  27.04 
 
 
435 aa  99  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  27.45 
 
 
433 aa  97.8  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5134  HipA domain-containing protein  28.38 
 
 
450 aa  96.7  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.868376  normal  0.708085 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1775  HipA N-terminal domain protein  29.74 
 
 
404 aa  94.4  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.474256  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0282  HipA domain-containing protein  29.43 
 
 
451 aa  94.4  4e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6813  HipA N-terminal domain protein  28.61 
 
 
418 aa  93.2  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  27.95 
 
 
413 aa  92.8  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  30.56 
 
 
419 aa  91.7  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  29 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1915  hypothetical protein  29.57 
 
 
431 aa  89.7  9e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1068  HipA domain-containing protein  28.61 
 
 
453 aa  89.4  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.579198 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>