100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1765 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E1765  protein HipA  100 
 
 		 176 aa  364  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  97.16 
 
 		 440 aa  357  6e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  97.16 
 
 		 440 aa  357  6e-98  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  97.16 
 
 		 440 aa  357  6e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  97.16 
 
 		 440 aa  357  6e-98  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  97.16 
 
 		 440 aa  357  6e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2121  protein HipA  97.16 
 
 		 351 aa  354  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.218209 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1802  transcriptional regulator, HipA-like  57.14 
 
 		 440 aa  213  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0497  HipA domain-containing protein  56.69 
 
 		 438 aa  187  5e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3846  HipA domain-containing protein  54.78 
 
 		 439 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4244  HipA N-terminal domain protein  52.87 
 
 		 439 aa  177  9e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0307  HipA-like protein  54.14 
 
 		 435 aa  174  7e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2033  HipA domain-containing protein  42.6 
 
 		 435 aa  147  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.420759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1477  HipA domain-containing protein  44.44 
 
 		 441 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2897  HipA N-terminal domain protein  44.94 
 
 		 439 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0064  HipA protein, DNA binding regulator  42.41 
 
 		 434 aa  140  9.999999999999999e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2301  HipA domain-containing protein  39.41 
 
 		 437 aa  134  5e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.752319  normal  0.112429 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2351  protein HipA  42.18 
 
 		 435 aa  129  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2443  HipA protein  41.14 
 
 		 435 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.793431  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4275  HipA domain-containing protein  38.99 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.221231 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1366  hypothetical protein  39.31 
 
 		 444 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2152  putative regulatory protein HipA  36.87 
 
 		 450 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.748793  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0635  hipA protein  36.87 
 
 		 622 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4814  protein HipA  37.57 
 
 		 442 aa  117  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0680  putative regulatory protein HipA  36.87 
 
 		 450 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1593  hipA protein  36.87 
 
 		 450 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2002  hipA protein  36.87 
 
 		 450 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2237  putative regulatory protein HipA  36.87 
 
 		 450 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3700  HipA N-terminal domain protein  37.43 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.717858  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4225  HipA domain-containing protein  37.97 
 
 		 444 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1916  putative regulatory protein  38.82 
 
 		 441 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5532  HipA domain-containing protein  36.48 
 
 		 380 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0132432 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3807  HipA domain-containing protein  38.99 
 
 		 444 aa  115  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.42944 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3330  putative regulatory protein  37.93 
 
 		 450 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.872604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5959  HipA domain-containing protein  37.87 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.428756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4520  HipA domain-containing protein  39.1 
 
 		 440 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  36.71 
 
 		 443 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0093  HipA N-terminal domain protein  39.18 
 
 		 440 aa  112  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0648821  normal  0.0261273 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3947  HipA-like protein  38.82 
 
 		 446 aa  111  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1446  putative HIPA transcription regulator protein  36.93 
 
 		 445 aa  110  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4153  hypothetical protein  35.8 
 
 		 450 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5917  HipA N-terminal domain protein  38.15 
 
 		 445 aa  110  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.902916  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3971  HipA-like  37.74 
 
 		 446 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0156  HipA-like protein  36.08 
 
 		 433 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0383905  hitchhiker  0.00201616 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4396  HipA domain-containing protein  37.74 
 
 		 446 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0337  HipA-like  40.38 
 
 		 440 aa  108  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.228503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2578  HipA domain-containing protein  35.85 
 
 		 435 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0920682  hitchhiker  0.0000863412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2612  HipA domain-containing protein  35.85 
 
 		 435 aa  105  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0398407  hitchhiker  0.000000000000030159 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1623  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  35.85 
 
 		 446 aa  103  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00823603  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1506  putative HipA-like protein  35.19 
 
 		 449 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.265752  normal  0.0493341 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4901  HipA N-terminal domain protein  35.85 
 
 		 446 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.069886  normal  0.125288 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5635  HipA domain-containing protein  36.48 
 
 		 447 aa  99.8  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.525846  normal  0.14054 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6086  HipA N-terminal domain protein  34.68 
 
 		 446 aa  91.3  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4031  HipA N-terminal domain protein  40 
 
 		 222 aa  81.3  0.000000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  44.44 
 
 		 414 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  42.67 
 
 		 425 aa  65.5  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0859  hypothetical protein  28.79 
 
 		 312 aa  55.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000274467 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2712  putative HipA protein  26.26 
 
 		 418 aa  55.1  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.610569 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27630  HipA domain-containing protein  28.79 
 
 		 411 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.180686  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1137  HipA domain-containing protein  38.46 
 
 		 426 aa  52.4  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.965885  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2261  HipA N-terminal domain protein  24.62 
 
 		 419 aa  51.6  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.573422  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0521  HipA domain-containing protein  38.03 
 
 		 422 aa  51.6  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0678  HipA domain-containing protein  26.47 
 
 		 433 aa  51.6  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0617  HipA-like  36.78 
 
 		 416 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1756  HipA N-terminal domain protein  39.19 
 
 		 461 aa  50.8  0.000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1919  HipA N-terminal domain protein  50 
 
 		 430 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.109564  normal  0.999152 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  34.23 
 
 		 434 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  39.29 
 
 		 434 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03630  HipA domain-containing protein  24.83 
 
 		 427 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.524354  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  39.29 
 
 		 434 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  39.29 
 
 		 434 aa  48.5  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0650  HipA domain-containing protein  26.71 
 
 		 433 aa  48.5  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  26.44 
 
 		 435 aa  47.8  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  26.49 
 
 		 420 aa  47  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1444  hypothetical protein  30.67 
 
 		 454 aa  47.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.291838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 420 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  29.09 
 
 		 420 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0558  HipA domain-containing protein  25.26 
 
 		 423 aa  45.8  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  29.09 
 
 		 420 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1224  HipA N-terminal domain protein  30.26 
 
 		 480 aa  45.8  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.581012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0210  HipA domain protein  32.43 
 
 		 318 aa  45.4  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  28.18 
 
 		 420 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0670  HipA N-terminal domain protein  26.11 
 
 		 433 aa  45.4  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2281  protein related to capsule biosynthesis enzymes, HipA-like  47.73 
 
 		 430 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3395  HipA domain-containing protein  25.26 
 
 		 433 aa  45.1  0.0005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00252233 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3972  HipA domain-containing protein  33.7 
 
 		 409 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5679  HipA domain-containing protein  36.96 
 
 		 362 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  35.62 
 
 		 449 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4571  HipA domain-containing protein  21.48 
 
 		 435 aa  43.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000268892 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0375  HipA domain-containing protein  22.22 
 
 		 434 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000000772638 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  32.43 
 
 		 318 aa  43.5  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  24.55 
 
 		 433 aa  43.5  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  26.77 
 
 		 418 aa  42.4  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  36.25 
 
 		 422 aa  42  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  43.59 
 
 		 412 aa  41.6  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4571  HipA-like  42.22 
 
 		 437 aa  41.2  0.007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.31649 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  34.15 
 
 		 412 aa  41.2  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2873  HipA N-terminal domain protein  50 
 
 		 396 aa  41.2  0.008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3754  HipA N-terminal domain protein  30.43 
 
 		 418 aa  40.8  0.009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0494  hypothetical protein  29.23 
 
 		 318 aa  41.2  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>