186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6144 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  837    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  40.28 
 
 		 407 aa  252  1e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  35.05 
 
 		 440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  35.05 
 
 		 440 aa  210  4e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  35.68 
 
 		 412 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  35.92 
 
 		 430 aa  205  9e-52  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  35.77 
 
 		 430 aa  200  5e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  35.73 
 
 		 435 aa  199  6e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  37.3 
 
 		 420 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  35 
 
 		 430 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  36.29 
 
 		 460 aa  195  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  33.58 
 
 		 419 aa  193  6e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  35.82 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  35.05 
 
 		 429 aa  188  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  34.23 
 
 		 404 aa  185  1.0000000000000001e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  32.56 
 
 		 411 aa  182  1e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  36.92 
 
 		 410 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  33.74 
 
 		 330 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  35.11 
 
 		 387 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  33.85 
 
 		 415 aa  180  4.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  35.19 
 
 		 410 aa  179  7e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  33.76 
 
 		 415 aa  178  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  33.74 
 
 		 421 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  33.42 
 
 		 414 aa  175  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  35.29 
 
 		 409 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  34.96 
 
 		 418 aa  172  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  32.81 
 
 		 441 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  32.89 
 
 		 415 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  34.94 
 
 		 420 aa  170  5e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  32.45 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  38.24 
 
 		 420 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  32.77 
 
 		 414 aa  162  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  34.32 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  33.33 
 
 		 415 aa  160  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  31.15 
 
 		 415 aa  159  1e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  35.27 
 
 		 414 aa  155  1e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  32.1 
 
 		 435 aa  154  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  35.31 
 
 		 417 aa  154  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  33.42 
 
 		 414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  34.45 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  32.68 
 
 		 431 aa  151  2e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  33.6 
 
 		 414 aa  149  8e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  32.99 
 
 		 423 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  30.15 
 
 		 429 aa  134  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  31.68 
 
 		 407 aa  134  3e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  32.09 
 
 		 425 aa  133  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  30.94 
 
 		 405 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  30.65 
 
 		 408 aa  130  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  31.65 
 
 		 390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  29.09 
 
 		 405 aa  122  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  31.79 
 
 		 431 aa  120  6e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  30.88 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  27.74 
 
 		 418 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  28.71 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  33.44 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  24.76 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  31.04 
 
 		 418 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  26.99 
 
 		 424 aa  107  3e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  27.57 
 
 		 430 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  26.72 
 
 		 433 aa  103  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  26.78 
 
 		 419 aa  102  9e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  30.63 
 
 		 444 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  26.78 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  27.05 
 
 		 429 aa  102  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  27.1 
 
 		 449 aa  102  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  26.09 
 
 		 392 aa  100  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  27.46 
 
 		 431 aa  99.4  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  27.82 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  28.81 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  27.06 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  27.3 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  27.3 
 
 		 419 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  29.5 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  27.09 
 
 		 435 aa  96.7  7e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  25.51 
 
 		 433 aa  94.4  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  27.79 
 
 		 426 aa  92.8  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  24.63 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  29.07 
 
 		 419 aa  89  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  30.56 
 
 		 295 aa  88.6  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03586  HipA  26.33 
 
 		 425 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01469  regulator with hipB  24.86 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2139  HipA N-terminal domain protein  24.86 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00420525  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2150  HipA domain-containing protein  24.86 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.170955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01479  hypothetical protein  24.86 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1590  protein HipA  24.86 
 
 		 440 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.943886  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0292  HipA N-terminal domain protein  33.33 
 
 		 414 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  30.97 
 
 		 430 aa  71.2  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  35.04 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2160  HipA domain-containing protein  26.22 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1299  HipA domain protein  24.75 
 
 		 395 aa  67  0.0000000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4225  hypothetical protein  27.85 
 
 		 443 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.43643 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  31.18 
 
 		 420 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2955  HipA N-terminal domain protein  27.06 
 
 		 432 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3688  HipA N-terminal domain protein  26.96 
 
 		 403 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.649488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1548  HipA domain-containing protein  34.41 
 
 		 413 aa  65.5  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0470095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  31.18 
 
 		 420 aa  65.5  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  30.36 
 
 		 420 aa  64.7  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5805  HipA domain-containing protein  31.72 
 
 		 413 aa  64.7  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0420791 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  31.51 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0511  HipA-like  32.21 
 
 		 422 aa  63.5  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0104648  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>