121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3753 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2924  hypothetical protein  74.88 
 
 		 431 aa  654    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000413391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4035  HipA-like  91.39 
 
 		 419 aa  795    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.190145  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3753  HipA domain-containing protein  100 
 
 		 419 aa  864    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4331  HipA domain-containing protein  91.39 
 
 		 419 aa  795    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.842416  normal  0.577395 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4227  HipA domain-containing protein  96.65 
 
 		 419 aa  836    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3588  HipA domain-containing protein  48.44 
 
 		 391 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252568  normal  0.492905 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1137  hypothetical protein  40.05 
 
 		 418 aa  291  1e-77  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.185234  normal  0.0419305 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2637  HipA domain-containing protein  33.49 
 
 		 433 aa  199  7e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000320909  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0159  HipA domain protein  32.45 
 
 		 380 aa  187  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2229  HipA domain protein  31.97 
 
 		 429 aa  169  7e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4376  HipA domain-containing protein  32.41 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0338797  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2599  HipA domain-containing protein  33.59 
 
 		 444 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0465  HipA domain-containing protein  33.51 
 
 		 419 aa  166  5e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1467  HipA domain protein  28.94 
 
 		 433 aa  166  5e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00227623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0101  hypothetical protein  29.3 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.292641  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04069  HipA domain protein  30.37 
 
 		 424 aa  165  1.0000000000000001e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3781  hypothetical protein  29.63 
 
 		 430 aa  164  4.0000000000000004e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.42028 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0092  hypothetical protein  30.18 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4363  HipA domain-containing protein  30.14 
 
 		 449 aa  160  3e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0212485  normal  0.0590338 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4311  HipA domain-containing protein  34.04 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.340239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0109  HipA domain protein  30.37 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2426  HipA-like protein  32.28 
 
 		 430 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0495  HipA domain-containing protein  33.92 
 
 		 411 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2264  HipA domain-containing protein  30.37 
 
 		 435 aa  153  5e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0628  HipA domain-containing protein  30.34 
 
 		 392 aa  152  8e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000875188 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2664  hypothetical protein  29.15 
 
 		 439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1315  hypothetical protein  27.32 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1474  HipA domain protein  28.98 
 
 		 426 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.738708  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4190  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.196944 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6144  hypothetical protein  26.78 
 
 		 412 aa  102  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0266  HipA domain protein  27.46 
 
 		 414 aa  97.4  4e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.506615  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9054  hypothetical protein  30.28 
 
 		 414 aa  93.2  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2057  HipA domain protein  26.32 
 
 		 421 aa  90.5  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5216  HipA domain-containing protein  29 
 
 		 420 aa  89.4  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.939418  normal  0.517526 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0477  HipA domain-containing protein  29.68 
 
 		 415 aa  88.6  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5437  HipA domain-containing protein  26.54 
 
 		 423 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2868  hypothetical protein  28.98 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2365  HipA domain-containing protein  29.27 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0940993  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0620  HipA domain-containing protein  25.77 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7391  hypothetical protein  29.19 
 
 		 415 aa  82  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5344  HipA domain-containing protein  29.33 
 
 		 415 aa  82.4  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.71584 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0237  HipA domain protein  28.79 
 
 		 415 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1974  hypothetical protein  27.73 
 
 		 410 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0226  HipA-like protein  31.64 
 
 		 415 aa  79.7  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3690  HipA domain protein  27.7 
 
 		 414 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.325167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4338  HipA domain-containing protein  28.05 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.850917 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0896  HipA domain-containing protein  27.03 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0949  HipA domain protein  25.89 
 
 		 414 aa  75.1  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2039  amidophosphoribosyl transferase  27.76 
 
 		 404 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0263  HipA domain-containing protein  27.01 
 
 		 430 aa  73.6  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0522  hypothetical protein  24.2 
 
 		 408 aa  73.2  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1056  hypothetical protein  26.21 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2079  hypothetical protein  28.42 
 
 		 410 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1566  HipA-like  27.33 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0325  HipA domain protein  28.34 
 
 		 430 aa  72  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2093  HipA domain-containing protein  26.46 
 
 		 412 aa  70.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.244247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3279  HipA domain protein  28.16 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.153165  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4463  HipA domain-containing protein  24.69 
 
 		 440 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4145  HipA-like  26.97 
 
 		 407 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.713937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3717  HipA domain protein  27.78 
 
 		 435 aa  68.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.880345  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03320  hypothetical protein  26.48 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.79257  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7006  HipA domain protein  23.84 
 
 		 440 aa  67.8  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1983  HipA domain-containing protein  24.63 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.435879  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2931  hypothetical protein  27.66 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.431501  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4194  hypothetical protein  44.74 
 
 		 120 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.323194 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0864  HipA domain-containing protein  24.09 
 
 		 435 aa  67  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2399  hypothetical protein  28.32 
 
 		 387 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4200  hypothetical protein  26.79 
 
 		 414 aa  63.2  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.250516 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1246  hypothetical protein  27.3 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6228  uncharacterized protein related to capsule biosynthesis enzyme-like  26.1 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.707965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4942  HipA domain-containing protein  26.42 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2229  hypothetical protein  22.88 
 
 		 433 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0672  HipA domain-containing protein  24.46 
 
 		 457 aa  57.8  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0157438  decreased coverage  0.000108623 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0261  HipA domain protein  30.3 
 
 		 152 aa  57.4  0.0000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3419  HipA domain protein  27.43 
 
 		 425 aa  56.6  0.0000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2735  HipA protein  30.05 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3381  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 		 420 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.391293  hitchhiker  0.00344758 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3248  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 		 420 aa  53.9  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.980858  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3479  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 		 420 aa  53.5  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282724 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1871  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.911703  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3351  HipA domain-containing protein  27.71 
 
 		 420 aa  53.5  0.000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3421  HipA N-terminal domain protein  24.42 
 
 		 412 aa  52.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0403  HipA domain-containing protein  23.97 
 
 		 430 aa  50.8  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2958  HipA domain-containing protein  28.57 
 
 		 431 aa  50.8  0.00005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1557  HipA domain protein  24.13 
 
 		 435 aa  50.4  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4918  HipA domain-containing protein  24.13 
 
 		 429 aa  50.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.53112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0550  HipA N-terminal domain protein  29.03 
 
 		 404 aa  49.7  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1252  HipA-like  26.32 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6580  HipA domain-containing protein  26.32 
 
 		 434 aa  49.7  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00079  Amidophosphoribosyl transferase  24.12 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0226  HipA domain protein  27.27 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04052  HipA-like protein  27.22 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6255  HipA domain-containing protein  26.32 
 
 		 434 aa  47.8  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4151  transposase, IS4 family protein  27.03 
 
 		 435 aa  47.8  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4128  HipA domain-containing protein  26.13 
 
 		 431 aa  47.4  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.871834  normal  0.173226 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5912  HipA domain protein  24.23 
 
 		 410 aa  47  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0247  HipA domain-containing protein  27.78 
 
 		 318 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6540  HipA domain-containing protein  25.91 
 
 		 434 aa  46.6  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0706  hypothetical protein  23.67 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4573  HipA domain-containing protein  25.61 
 
 		 418 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000280036 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>